More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2153 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  100 
 
 		 148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1757  hypothetical protein  46.62 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3172  hypothetical protein  44.83 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1091  hypothetical protein  43.26 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055725 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1177  methylation  41.84 
 
 		 178 aa  87.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  33.8 
 
 		 152 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  31.39 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  33.11 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  33.1 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  30.52 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  31.88 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  31.88 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  31.88 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  31.88 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  31.88 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  31.88 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  31.82 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  32.62 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  31.82 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  32.85 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  32.09 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  31.85 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  32.43 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  32.84 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  32.84 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  30.94 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  42.86 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  30.99 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  31.67 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  30.57 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  29.45 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  31.62 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  30.66 
 
 		 158 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  30.15 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  30.94 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  34.41 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  32.84 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  29.29 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  37.88 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  30.94 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  32.12 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  30.88 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  28.97 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  30.88 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  28.77 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  27.21 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  30.23 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  31.88 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  28.77 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  28.77 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  28.77 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  28.08 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  30.37 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  28.77 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  29.17 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  29.17 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  30.99 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  29.17 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  30.15 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  27.97 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  28.18 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  31.33 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  30.28 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  28.68 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  29.41 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  32.12 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  29.55 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  31.21 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  28.8 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  33.65 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  28.47 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  27.94 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  27.69 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  27.94 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  28.47 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  30.43 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2650  general secretion pathway protein G  30.13 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  30.5 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  38.67 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  29.45 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  27.21 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  28.06 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  32.61 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  31.39 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  39.71 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  27.21 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  29.85 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  29.85 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  29.85 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  29.85 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  27.86 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  32.61 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  29.85 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  29.85 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  29.85 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  32.61 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>