More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1024 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  40.34 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  35.88 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  33.58 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  35.88 
 
 		 142 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  33.58 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  33.58 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  35.88 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  33.58 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  33.58 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  34.25 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  36.7 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  32.85 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  33.59 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  32.35 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  32.85 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  32.85 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  33.58 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  34.11 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  32.62 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  35.42 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  33.08 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  32.35 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  37.04 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  31.72 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  32.12 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  33.82 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  35.78 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  35.78 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  35.78 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  35.78 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  35.78 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  29.69 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  35.19 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  30.08 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  37.37 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  42.25 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  42.25 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  31.78 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  35.78 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  26.92 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.15 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  31.78 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  31.78 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  30.37 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  29.92 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  29.92 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  29.92 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  29.92 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  35.05 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  31.68 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  32.23 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  30.08 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  29.51 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  31.3 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  37.84 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  30.08 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2706  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  37.4 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.363205 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  33.09 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  26.92 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  30.47 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  36.49 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  35.45 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.9 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  26.92 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  33.91 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  29.2 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  35.64 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  33.06 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  31.62 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  29.71 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  37.74 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  30.47 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  34.65 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  32.37 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  35.58 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  31.16 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  38.78 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  36.7 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  25.95 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  37 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  38.96 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  31.16 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  35.58 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  35.58 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  35.58 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0384  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.54833 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  35.58 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  35.58 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  35.58 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  35.58 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  35.58 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  30.95 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  41.27 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  37.66 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>