More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2706 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2706  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  100 
 
 
160 aa  319  8e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.363205 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  37.4 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2778  general secretion pathway protein G  33.06 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  29.84 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  35.94 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  27.87 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  28.99 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  33.59 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  33.61 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  31.71 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  30.33 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  33.06 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  34.45 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  33.06 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  36 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  36 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  36 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  36 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  36 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  36 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  36 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  36 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  32.12 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  28.23 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  32.52 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  33.06 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  30.08 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  33.88 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  33.06 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  29.55 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  29.29 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  31.39 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  31.19 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  29.71 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  40 
 
 
122 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  29.79 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  28.12 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  29.03 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29510  putative type II secretion system protein  26.19 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  35.21 
 
 
124 aa  62  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  28.24 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  28.24 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  34.65 
 
 
166 aa  61.6  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  30.71 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  27.69 
 
 
150 aa  61.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  29.75 
 
 
154 aa  61.2  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  27.73 
 
 
209 aa  60.5  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  28.68 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  29.63 
 
 
150 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  27.08 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  31.82 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  29.87 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  26.72 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  39.06 
 
 
184 aa  58.9  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  28.23 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  36.92 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1528  general secretion pathway protein G  30.65 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.430889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  24.59 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  24.37 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  24.37 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  24.37 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  26.4 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  27.08 
 
 
130 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  29.92 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 
126 aa  58.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2895  general secretion pathway protein G  29.85 
 
 
160 aa  58.2  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  24.59 
 
 
144 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  25.76 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  25.76 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  25.76 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  25.76 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  30.83 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  33.64 
 
 
147 aa  57.8  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  24 
 
 
144 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  29.03 
 
 
145 aa  57.4  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  28.35 
 
 
153 aa  57.4  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  26.36 
 
 
151 aa  57.4  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  31.71 
 
 
163 aa  57.4  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  29.92 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  25.76 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  25.95 
 
 
149 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  33.85 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  23.77 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  26.87 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  26.87 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3525  hypothetical protein  35.62 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00449865  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  25.37 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  27.64 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  31.34 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  30.3 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  24.63 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  40.3 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  26.56 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  25.37 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>