More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1302 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  64.1 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  62.5 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  62.07 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  57.02 
 
 		 124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  57.02 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  57.02 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  58.18 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  59.13 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  56.14 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  56.14 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  56.76 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  52.63 
 
 		 124 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  56.76 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  57.41 
 
 		 184 aa  127  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  58.18 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  50.81 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  50.88 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  53.57 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  50 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  46.67 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  47.58 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  48.25 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  45.16 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  45.16 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  41.32 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  48.8 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  45.37 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  46.32 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  40 
 
 		 223 aa  88.2  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  36.49 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  34.13 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  40.66 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  31.09 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  31.09 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  37.76 
 
 		 172 aa  62  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  36.05 
 
 		 158 aa  62  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  29.82 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  31.37 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  31.37 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  28.95 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  28.95 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  36.88 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  28.95 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  31.37 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  31.37 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  35.46 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  40.78 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  31.97 
 
 		 156 aa  60.1  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  35.79 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  32.52 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  36.27 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  35.16 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  29.01 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  31.31 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  32.73 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  30.39 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  33.93 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  37.96 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  36.08 
 
 		 150 aa  57  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2778  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  36.26 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  28.15 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  29.41 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  34.69 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  34.38 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  35.66 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  30.08 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  31.25 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  31.25 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  32.67 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  34.34 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.54 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1528  general secretion pathway protein G  35.43 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.430889 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  33.98 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  34.56 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1439  general secretion pathway GspG related transmembrane protein  36.55 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0119159  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  31.62 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  32.65 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  32.65 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  27.41 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  37.25 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  29.41 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  32.65 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  31.43 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  32.04 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>