214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2582 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  100 
 
 
170 aa  345  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  58.17 
 
 
172 aa  188  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  59.09 
 
 
168 aa  187  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  62.5 
 
 
157 aa  186  9e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  61.44 
 
 
159 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  55.06 
 
 
161 aa  179  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  56.58 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  51.63 
 
 
160 aa  154  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  51.27 
 
 
176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  48.39 
 
 
172 aa  148  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  48.75 
 
 
158 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  55.92 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1335  methylation  51.97 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0885873  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  49.04 
 
 
157 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3477  hypothetical protein  50.32 
 
 
159 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103302  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2460  secretion type II protein  49.68 
 
 
159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839329  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2294  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  49.04 
 
 
159 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.797755  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2469  G protein signal peptide-like secretion type II protein  48.08 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354384  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1439  general secretion pathway GspG related transmembrane protein  48.7 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0119159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  41.77 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  40 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  40.65 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  42.24 
 
 
164 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  43.12 
 
 
161 aa  99  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  38.51 
 
 
177 aa  96.3  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2414  general secretion pathway protein G  40.37 
 
 
164 aa  92  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1285  hypothetical protein  41.1 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  36.48 
 
 
137 aa  84.3  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2998  hypothetical protein  38.65 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000440497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1461  hypothetical protein  41.77 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  30.77 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  34.12 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  32.3 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  34.64 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  29.41 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  29.41 
 
 
138 aa  72  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  36.49 
 
 
124 aa  70.5  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  32.1 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  31.37 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  33.99 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  30.41 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  34.64 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  30.92 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  34.96 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  29.61 
 
 
133 aa  61.2  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  35.65 
 
 
129 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  26.8 
 
 
131 aa  60.8  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  37.14 
 
 
128 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 
124 aa  58.2  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  37.14 
 
 
124 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  36.54 
 
 
130 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  35.24 
 
 
124 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  36.19 
 
 
124 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  37.14 
 
 
124 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  29.56 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  35.51 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  32.95 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  39.66 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  32.47 
 
 
131 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  31.58 
 
 
146 aa  51.6  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  45.45 
 
 
165 aa  50.8  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  30.83 
 
 
158 aa  50.8  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  30.94 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.04 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  32.58 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.31 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  28.07 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  26.9 
 
 
138 aa  49.3  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  29.37 
 
 
144 aa  48.5  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  31.46 
 
 
142 aa  48.5  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  31.48 
 
 
146 aa  48.5  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  32.37 
 
 
141 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  44.23 
 
 
132 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.95 
 
 
172 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  30.58 
 
 
150 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  28.67 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  28.67 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.31 
 
 
152 aa  47.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  34.85 
 
 
176 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  27.4 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  28.67 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  44 
 
 
140 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.62 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  40 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  32.48 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.38 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1303  hypothetical protein  30.83 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529272  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.23 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  46.3 
 
 
141 aa  45.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  29.55 
 
 
144 aa  45.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.88 
 
 
174 aa  45.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.38 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3219  hypothetical protein  28.3 
 
 
177 aa  45.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.77 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  33.73 
 
 
179 aa  45.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  44.68 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  31.13 
 
 
153 aa  45.1  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>