118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4795 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  100 
 
 		 223 aa  458  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  43.18 
 
 		 129 aa  105  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  40.6 
 
 		 126 aa  99.4  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  38.13 
 
 		 128 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  36.03 
 
 		 140 aa  93.2  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  37.31 
 
 		 124 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  37.21 
 
 		 126 aa  91.7  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  36.57 
 
 		 124 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  34.31 
 
 		 133 aa  90.5  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  37.68 
 
 		 128 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  38.58 
 
 		 138 aa  90.1  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 		 124 aa  89.7  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  36.09 
 
 		 138 aa  88.6  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  40 
 
 		 124 aa  88.2  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  37.31 
 
 		 124 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  36.36 
 
 		 124 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  38.17 
 
 		 129 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  37.88 
 
 		 137 aa  85.9  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  34.75 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  35.25 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  36.75 
 
 		 121 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  37.9 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  32.61 
 
 		 135 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  31.51 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  37.7 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  36.79 
 
 		 145 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  30.46 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  34.45 
 
 		 130 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  30.71 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  34 
 
 		 135 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  28.7 
 
 		 154 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  27.18 
 
 		 150 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  27.18 
 
 		 150 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  27.18 
 
 		 150 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  27.18 
 
 		 150 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  27.18 
 
 		 150 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  27.18 
 
 		 150 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  26.32 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  25 
 
 		 144 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  26.17 
 
 		 148 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0347967 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  26.47 
 
 		 151 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  24.04 
 
 		 144 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  26.47 
 
 		 151 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  24.04 
 
 		 144 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  24.04 
 
 		 144 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  24.04 
 
 		 144 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  24.04 
 
 		 144 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  23.81 
 
 		 150 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  26.47 
 
 		 151 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  26.47 
 
 		 151 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  26.21 
 
 		 150 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  26.47 
 
 		 151 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  30.77 
 
 		 143 aa  50.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  29.81 
 
 		 160 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  27.36 
 
 		 154 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  26.47 
 
 		 151 aa  49.3  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  32.67 
 
 		 159 aa  48.5  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  31 
 
 		 156 aa  48.5  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  27.1 
 
 		 156 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  23.08 
 
 		 144 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  32.67 
 
 		 159 aa  48.5  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  23.08 
 
 		 144 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  23.08 
 
 		 144 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  23.08 
 
 		 144 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  30.77 
 
 		 142 aa  48.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  26.8 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  26.42 
 
 		 154 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  27 
 
 		 143 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  26 
 
 		 153 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  26.51 
 
 		 161 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  24.04 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  26.73 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  30.3 
 
 		 142 aa  47  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  25.51 
 
 		 156 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  25.25 
 
 		 150 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  27.04 
 
 		 168 aa  46.6  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  28.22 
 
 		 158 aa  47  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  25.25 
 
 		 150 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  26.32 
 
 		 155 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  25.25 
 
 		 150 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  25.25 
 
 		 150 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  25.25 
 
 		 150 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  25.25 
 
 		 150 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  25.25 
 
 		 150 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  25.25 
 
 		 150 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  23.3 
 
 		 146 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  23.08 
 
 		 144 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  26 
 
 		 158 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  26.21 
 
 		 159 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 150 aa  46.2  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  24.49 
 
 		 140 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  24.49 
 
 		 140 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  27.18 
 
 		 149 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  25 
 
 		 150 aa  45.8  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  29.11 
 
 		 172 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  25.71 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  25.77 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  30.11 
 
 		 162 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  26.61 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  30.1 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>