More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2895 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2895  general secretion pathway protein G  100 
 
 		 160 aa  327  4e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  38.73 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  38.73 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  38.73 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  36.13 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  38.73 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  38.73 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  38.73 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  36.13 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  32.14 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  36.13 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  36.13 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  35.22 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  37.16 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  35.62 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  37.14 
 
 		 158 aa  84  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  36.18 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  36.62 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  34.84 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  36.69 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  34.84 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  36.69 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  34.84 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  35.19 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  36.18 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  32.72 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  36.42 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  37.58 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  36.54 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  36.55 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  35.17 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  37.32 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  33.11 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  36.84 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  34.01 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  34.57 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  34.62 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  34.62 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  34.57 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  35.77 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  34.62 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  35.42 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  35.42 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  35.06 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  35.42 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  34.75 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  35.42 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  35.42 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  35.42 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  35.42 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  35.42 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  35.17 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  37.14 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  33.57 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  33.57 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0902  general secretion pathway protein G  35.17 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  34.75 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  33.55 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  36.88 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  34.75 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  33.55 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  34.75 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  34.75 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  34.75 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  31.94 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  32.86 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  34.75 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  31.94 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  31.94 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  34.75 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  32.88 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  34.42 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  34.72 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  33.79 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  34.75 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  34.75 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  34 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  35.14 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3521  general secretion pathway protein G  36.92 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0236971  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  31.72 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  35.92 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  34.78 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  35.21 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2215  general secretion pathway protein G  34.23 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  32.62 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  34 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  34.46 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  36.43 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  37.82 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  34.11 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  35.26 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  37.82 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  32.67 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  31.29 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  32.64 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>