More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3525 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3525  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  332  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00449865  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  40.3 
 
 
193 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  31.2 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  39.76 
 
 
150 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  38.2 
 
 
154 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  39.76 
 
 
150 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  39.76 
 
 
150 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  40.3 
 
 
144 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  41.18 
 
 
150 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  41.18 
 
 
150 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  32.04 
 
 
157 aa  60.8  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  40.3 
 
 
144 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  38.2 
 
 
154 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  43.75 
 
 
150 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  43.75 
 
 
150 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  31.4 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  31.4 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  35.82 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  35.82 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  31.4 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  40 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  31.15 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  31.4 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  31.4 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  29 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  38.81 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  38.24 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  38.57 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  38.57 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.66 
 
 
157 aa  58.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  34.12 
 
 
147 aa  58.2  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  33.75 
 
 
148 aa  58.2  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  30.65 
 
 
148 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  30.65 
 
 
142 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  38.33 
 
 
162 aa  57.4  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  38.27 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  38.27 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  38.27 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  28.87 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  38.27 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  38.27 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.38 
 
 
121 aa  57  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.88 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  38.27 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  38.27 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  38.27 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  37.88 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  32.32 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  30 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  27.45 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  41.43 
 
 
323 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  32.52 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  25.96 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  35.82 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  35.82 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  28.46 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  29.9 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  41.54 
 
 
163 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  38.46 
 
 
163 aa  54.7  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 
144 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.53 
 
 
163 aa  54.3  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  34.65 
 
 
156 aa  54.3  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  26.8 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.1 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  26.8 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  26.8 
 
 
144 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  26.8 
 
 
144 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  26.8 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  39.68 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  29.41 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  36.49 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  26.8 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  30.88 
 
 
144 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  25.96 
 
 
144 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  29.41 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  29.41 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  26.8 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  26.8 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  29.84 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  36.92 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  26.67 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  26.26 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  29.27 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  33.04 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  26.8 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  31.71 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  28.36 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  34.21 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  42.19 
 
 
124 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  35.56 
 
 
326 aa  52.4  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  37.93 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  31.58 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>