More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1177 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1177  methylation  100 
 
 		 178 aa  364  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1757  hypothetical protein  53.95 
 
 		 166 aa  161  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3172  hypothetical protein  55.41 
 
 		 152 aa  148  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1091  hypothetical protein  55.41 
 
 		 171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  41.84 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  37.04 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  35.51 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  35.51 
 
 		 142 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  33.59 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  32.58 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  32.61 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 141 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  36.13 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  37.7 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  32.23 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  34.51 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  31.39 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  37.61 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  40.74 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  29.66 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  30.37 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  32.14 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  32.03 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  30.09 
 
 		 167 aa  62  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  31.73 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1722  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  33 
 
 		 143 aa  62  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  31.5 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  34.86 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  35.92 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  32.48 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  38.14 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  38.14 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  35.24 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  30.77 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  29.29 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  34.86 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  30.99 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  29.63 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  32 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.78 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  26.24 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  26.24 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  26.24 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  33.98 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  26.24 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  27.98 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  27.98 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  26.24 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  27.98 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  29.91 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  34.86 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  37.66 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  34.86 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  34.86 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  35.24 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  33.94 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  28.68 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  26.24 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  33.94 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  36.63 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  27.78 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  33.94 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  41.54 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  37.84 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  34.58 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  34.58 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0683  general secretion pathway protein G  32.04 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  35.9 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  27.94 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.31 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  32.46 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  27.54 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  26.21 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  27.14 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  31.67 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  29.7 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  35.4 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  36.9 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  28.8 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.28 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  37.68 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.83 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.28 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  39.13 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.28 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  39.13 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  27.93 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  37.86 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  37.86 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  37.88 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  28.04 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0718  general secretion pathway protein G  32.04 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0717  general secretion pathway protein G  32.04 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  28.37 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  32.38 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>