More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1158 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1158  Tfp pilus assembly protein PilE  100 
 
 		 135 aa  279  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  43.69 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  53.73 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  37.14 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  43.69 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  57.81 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  45.68 
 
 		 186 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  45.68 
 
 		 186 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1722  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.29 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.61 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  49.23 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  49.23 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  37.17 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  43.04 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  46.48 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  31.96 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  45.83 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  41.77 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.52 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  35.14 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.88 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  37.37 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.39 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.37 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  42.25 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.21 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  49.28 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  40.91 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  40.91 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.76 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  44.78 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  49.18 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  48.33 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  49.18 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  42.03 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  42.03 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  54.35 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  41.67 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  40.91 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  42.19 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  38.46 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  33.05 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  41.56 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  34.04 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  30.07 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.27 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  45 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  31.58 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  35.96 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  45.9 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  43.24 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  42.19 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  37.25 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  39.64 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  47.54 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  34.02 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  34.91 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  25.93 
 
 		 145 aa  57  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  25.93 
 
 		 145 aa  57  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  25.93 
 
 		 145 aa  57  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.89 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.27 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  33.33 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  37.18 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  40.3 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.03 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  45.9 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.46 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  39.74 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  39.74 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.52 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  35.77 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  34.95 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  39.73 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  39.74 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.82 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  39.74 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  39.74 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  39.74 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  35.43 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  35.19 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  33.77 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  39.74 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  41.67 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  43.33 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0303  type IV pilin  43.4 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.79 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  40 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  30.33 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.44 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  43.55 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.82 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  39.44 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  40.62 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  42.86 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.67 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>