210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3737 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3737  type II secretion pathway protein XcpT  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1722  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  35.44 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  29.37 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  33.12 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  31.58 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  31.21 
 
 		 148 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.27 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  31.21 
 
 		 142 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  32.7 
 
 		 161 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  42.03 
 
 		 323 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  31.47 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  30.07 
 
 		 147 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  33.8 
 
 		 155 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  32.93 
 
 		 172 aa  52.8  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  30.87 
 
 		 147 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0883  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 145 aa  52.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.31 
 
 		 157 aa  52.8  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  31.37 
 
 		 166 aa  52.4  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  33.1 
 
 		 166 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1528  general secretion pathway protein G  33.57 
 
 		 142 aa  52  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.430889 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 		 163 aa  52  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  33.11 
 
 		 152 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 		 155 aa  52  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2778  general secretion pathway protein G  38.84 
 
 		 149 aa  52  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  31.91 
 
 		 150 aa  51.6  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.75 
 
 		 165 aa  51.6  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  41.67 
 
 		 331 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  29.59 
 
 		 171 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  28.37 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  42.37 
 
 		 323 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  30.92 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  33.1 
 
 		 159 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.62 
 
 		 168 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.28 
 
 		 167 aa  50.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  30.34 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2650  general secretion pathway protein G  28.29 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  41.79 
 
 		 338 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 147 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.44 
 
 		 169 aa  50.1  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  32.24 
 
 		 160 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  49.7  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  25.34 
 
 		 162 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  38.2 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  28.06 
 
 		 353 aa  49.3  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  31.69 
 
 		 144 aa  49.3  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 153 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  32.64 
 
 		 154 aa  48.9  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  32.41 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.03 
 
 		 156 aa  48.9  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  37.84 
 
 		 177 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  37.29 
 
 		 348 aa  48.5  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  37.84 
 
 		 177 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  32.14 
 
 		 144 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  32.89 
 
 		 144 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0686  general secretion pathway protein G  35.17 
 
 		 161 aa  48.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0282491 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  30.4 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  34.02 
 
 		 326 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.44 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  33.1 
 
 		 155 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  34.59 
 
 		 150 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  31.98 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  38.98 
 
 		 324 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  38.98 
 
 		 325 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  38.98 
 
 		 330 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  37.29 
 
 		 349 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  41.27 
 
 		 130 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  30.95 
 
 		 137 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.28 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  43.55 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  38.46 
 
 		 352 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0683  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 137 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  38.24 
 
 		 153 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  40.26 
 
 		 124 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  37.04 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.26 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  31.72 
 
 		 158 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  40.26 
 
 		 124 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  40.26 
 
 		 128 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0717  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 137 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  34.85 
 
 		 140 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  34.85 
 
 		 140 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  37.7 
 
 		 140 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  38.36 
 
 		 138 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0879  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  36.36 
 
 		 141 aa  46.2  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0718  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 137 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  41.27 
 
 		 155 aa  45.8  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  40.68 
 
 		 313 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  42.03 
 
 		 124 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  31.88 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  26.9 
 
 		 145 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  26.9 
 
 		 145 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  26.9 
 
 		 145 aa  45.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  35.48 
 
 		 156 aa  45.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.38 
 
 		 147 aa  45.4  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  33.1 
 
 		 164 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  38.98 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  49.02 
 
 		 158 aa  45.4  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  28.47 
 
 		 149 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>