More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0015 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 
193 aa  399  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.37 
 
 
175 aa  112  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.5 
 
 
161 aa  111  6e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.1 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  39.18 
 
 
172 aa  107  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54 
 
 
163 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.87 
 
 
157 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.55 
 
 
169 aa  101  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  70.42 
 
 
147 aa  101  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.47 
 
 
179 aa  99.4  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  38.89 
 
 
174 aa  99  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  70.59 
 
 
156 aa  98.6  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.13 
 
 
165 aa  98.6  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.73 
 
 
170 aa  98.2  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  64.1 
 
 
182 aa  97.8  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.51 
 
 
151 aa  97.8  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.72 
 
 
158 aa  97.4  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  56.44 
 
 
171 aa  96.3  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  64.94 
 
 
79 aa  97.1  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
167 aa  95.1  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  55.68 
 
 
163 aa  94.4  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.38 
 
 
151 aa  93.6  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.61 
 
 
156 aa  93.2  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.58 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
169 aa  92.8  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.77 
 
 
152 aa  92.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.03 
 
 
171 aa  91.7  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.22 
 
 
155 aa  90.9  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.96 
 
 
167 aa  90.5  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.52 
 
 
163 aa  88.6  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.33 
 
 
168 aa  88.6  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.04 
 
 
172 aa  88.2  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  55.56 
 
 
168 aa  88.2  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  60.81 
 
 
152 aa  87.8  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.33 
 
 
159 aa  87.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  66.67 
 
 
167 aa  87  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  69.12 
 
 
166 aa  87  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  39.52 
 
 
155 aa  86.7  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.9 
 
 
163 aa  86.3  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.75 
 
 
165 aa  85.1  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.44 
 
 
161 aa  84.3  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  36.6 
 
 
174 aa  84.3  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.56 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  56.79 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  66.07 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  55.84 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  58.57 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.21 
 
 
165 aa  79  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  59.21 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.18 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.6 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  50.57 
 
 
136 aa  77.8  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  51.85 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  50.54 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  45.26 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  36.31 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  46.99 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  55.74 
 
 
152 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  44.3 
 
 
567 aa  68.9  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  47.37 
 
 
634 aa  67.8  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  41.18 
 
 
548 aa  67.4  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  45.45 
 
 
527 aa  67.4  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.34 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  43.28 
 
 
141 aa  62.4  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.22 
 
 
174 aa  62.4  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  43.48 
 
 
147 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  46.03 
 
 
164 aa  60.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  47.3 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  43.66 
 
 
130 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  47.3 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  44 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  68.89 
 
 
48 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  45.45 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  39.44 
 
 
133 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  37.5 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  47.06 
 
 
130 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  43.48 
 
 
186 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  36.88 
 
 
167 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  43.48 
 
 
186 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  30.91 
 
 
176 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  45 
 
 
141 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  45.31 
 
 
166 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  43.42 
 
 
145 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  32.58 
 
 
148 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.14 
 
 
141 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  41.43 
 
 
138 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  45 
 
 
169 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  50 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.1 
 
 
170 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.42 
 
 
130 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.42 
 
 
130 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.42 
 
 
130 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  40.85 
 
 
132 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.42 
 
 
130 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  67.57 
 
 
151 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0583  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.2 
 
 
166 aa  55.8  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000427106 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  45.31 
 
 
138 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  55.32 
 
 
182 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  38.33 
 
 
162 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  39.39 
 
 
153 aa  55.5  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>