More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1371 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  357  6e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.53 
 
 
163 aa  127  6e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.03 
 
 
154 aa  119  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.89 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.79 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.66 
 
 
158 aa  107  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.26 
 
 
156 aa  106  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.59 
 
 
155 aa  105  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.53 
 
 
169 aa  104  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.41 
 
 
171 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.26 
 
 
165 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.27 
 
 
147 aa  101  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.52 
 
 
151 aa  101  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.35 
 
 
175 aa  100  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  40.38 
 
 
168 aa  100  9e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.33 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.13 
 
 
161 aa  99.4  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.68 
 
 
157 aa  99  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.65 
 
 
156 aa  97.8  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  61.45 
 
 
163 aa  97.8  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.57 
 
 
151 aa  97.4  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.51 
 
 
170 aa  97.1  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  53.19 
 
 
182 aa  95.5  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  38.92 
 
 
155 aa  95.1  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.13 
 
 
157 aa  94  9e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.16 
 
 
167 aa  93.6  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.31 
 
 
168 aa  92.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  37.72 
 
 
172 aa  92  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.11 
 
 
165 aa  91.7  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.1 
 
 
163 aa  91.3  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.8 
 
 
167 aa  90.9  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.88 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.54 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  64.38 
 
 
79 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  58.62 
 
 
152 aa  88.6  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.66 
 
 
159 aa  88.2  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.29 
 
 
165 aa  88.2  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.14 
 
 
167 aa  88.2  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.38 
 
 
166 aa  87.8  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  37.66 
 
 
171 aa  87.4  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  39.88 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.53 
 
 
175 aa  85.1  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  35.09 
 
 
155 aa  85.1  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  57.53 
 
 
136 aa  85.1  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.59 
 
 
161 aa  85.1  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.14 
 
 
167 aa  84.3  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  36.63 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.53 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  35.23 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  40.59 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  36.99 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.56 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  48.15 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  37.28 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  36.48 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  30.64 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  35.63 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  59.65 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  47.62 
 
 
634 aa  68.2  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  47.62 
 
 
527 aa  67.8  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  48.19 
 
 
567 aa  67.4  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  44.44 
 
 
548 aa  64.7  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  81.08 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  86.11 
 
 
48 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  57.41 
 
 
178 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  34.4 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  51.79 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1300  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  59.62 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.86 
 
 
174 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  48.33 
 
 
152 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  43.24 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  43.24 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  37.93 
 
 
142 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  39.47 
 
 
186 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  65.79 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  39.47 
 
 
186 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.79 
 
 
121 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  50 
 
 
151 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  43.06 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  58.54 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  49.18 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  53.57 
 
 
111 aa  55.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  58.54 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  47.22 
 
 
130 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  58.54 
 
 
163 aa  55.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  47.22 
 
 
130 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  58.54 
 
 
196 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  46.67 
 
 
167 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  44.44 
 
 
170 aa  54.7  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  46.55 
 
 
138 aa  54.7  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  42.86 
 
 
169 aa  54.7  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  44.12 
 
 
169 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  48.28 
 
 
162 aa  54.3  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  36.11 
 
 
129 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  40.91 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  50 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  56.1 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  47.17 
 
 
142 aa  53.9  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  44.07 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>