258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1230 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  359  1e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.98 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.15 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.49 
 
 
157 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.15 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.15 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.62 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.79 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  53.33 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.98 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.23 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  38.89 
 
 
155 aa  70.5  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.78 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.35 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.35 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  32.58 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.83 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.03 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  35.83 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.79 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  44.3 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.11 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.07 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  46.15 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  59.65 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.3 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.11 
 
 
155 aa  67.4  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.89 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.57 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.32 
 
 
151 aa  63.5  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  39.02 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  62.75 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  45.45 
 
 
79 aa  62.8  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  57.41 
 
 
172 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.32 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  41.49 
 
 
169 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.29 
 
 
147 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  57.41 
 
 
174 aa  61.6  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.85 
 
 
163 aa  61.6  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  51.92 
 
 
527 aa  61.2  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  26.8 
 
 
167 aa  61.2  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  51.92 
 
 
634 aa  60.8  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  68.89 
 
 
48 aa  60.8  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.48 
 
 
154 aa  60.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  45.88 
 
 
171 aa  60.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.12 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  45.68 
 
 
136 aa  59.3  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  50 
 
 
567 aa  59.3  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.05 
 
 
151 aa  58.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  34.32 
 
 
168 aa  58.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  71.79 
 
 
158 aa  58.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  50 
 
 
182 aa  58.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.85 
 
 
172 aa  57.8  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.85 
 
 
171 aa  57.8  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.27 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  39.58 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  51.92 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  48 
 
 
548 aa  55.1  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  50.94 
 
 
141 aa  54.7  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.1 
 
 
157 aa  54.3  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  38.67 
 
 
188 aa  54.3  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  46.84 
 
 
167 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  48.08 
 
 
174 aa  54.3  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.26 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.36 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  44.07 
 
 
152 aa  52  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  38.27 
 
 
111 aa  51.6  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  29.93 
 
 
145 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  43.94 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  33.96 
 
 
137 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  35.58 
 
 
141 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  43.94 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  43.94 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0879  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  37.18 
 
 
141 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  32.86 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  27.34 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  53.66 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  34.88 
 
 
138 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  51.16 
 
 
182 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  39.34 
 
 
162 aa  48.9  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  35.59 
 
 
138 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0201  type IV pilin-related protein  34.69 
 
 
145 aa  48.1  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225415  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  53.66 
 
 
134 aa  48.1  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  40.68 
 
 
142 aa  48.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  53.66 
 
 
146 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  53.66 
 
 
146 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  53.66 
 
 
146 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  53.66 
 
 
146 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  53.66 
 
 
146 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  53.66 
 
 
146 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  47.73 
 
 
166 aa  47.8  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  47.73 
 
 
166 aa  47.8  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0666  putative major pilin subunit  51.22 
 
 
147 aa  47.8  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  53.66 
 
 
146 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  43.86 
 
 
142 aa  47.8  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  53.66 
 
 
145 aa  47.8  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  39.66 
 
 
179 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>