More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3550 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  100 
 
 		 164 aa  332  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  53.05 
 
 		 153 aa  185  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  46.15 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  42.31 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  32.72 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  31.45 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  37.06 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  31.48 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  33.75 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  34.59 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  34.16 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  36 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  31.1 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  32.93 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  48.15 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  40 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  31.21 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  33.54 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  36 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  50.82 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  50.82 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  30.19 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  33.12 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  33.12 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  44.62 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  50.77 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  50.77 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  27.91 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.45 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  27.81 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  33.56 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  49.23 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  28.75 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  37.74 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  45.16 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  42.25 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  32.52 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  42.42 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.15 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.5 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  48.28 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0717  putative type-4 frimbrial pilin-related signal peptide protein  29.3 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1287  type 4 fimbrial biogenesis signal peptide protein  33.95 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  46.67 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  28.47 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.83 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.07 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4842  hypothetical protein  33.54 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0454526  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2686  pilus assembly protein PilE  30.57 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  29.11 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0399  general secretion pathway protein H  34.59 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.76 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0193  pilus assembly protein PilE  34.19 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  44.83 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  41.67 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3170  prepilin-type cleavage/methylation  31.9 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.647515  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  32.69 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0778  putative Tfp pilus assembly protein PilE  33.57 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32654  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  51.79 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  41.07 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  40.32 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.71 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  50.79 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  40.74 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  40.68 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.59 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5684  pilus assembly protein PilE  32.91 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.148368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  31.06 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  46.55 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  35 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.19 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  40.32 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  34.85 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.34 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  34.78 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  44.44 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  60.53 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  30.38 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  51.92 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  48.39 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  46.77 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  34.65 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  60.53 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.33 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.59 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  49.09 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.98 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.98 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.98 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  28.66 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  44.64 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.98 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.98 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  50.91 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  46.67 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  39.68 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  47.27 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>