127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2686 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2686  pilus assembly protein PilE  100 
 
 		 158 aa  311  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0778  putative Tfp pilus assembly protein PilE  52.31 
 
 		 155 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32654  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0717  putative type-4 frimbrial pilin-related signal peptide protein  43.65 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  33.58 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0710  putative type-4 frimbrial pilin-related signal peptide protein  37.21 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16724  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0666  putative type-4 frimbrial pilin-related signal peptide protein  36.36 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal  0.345081 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  31.25 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  31.85 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  32.46 
 
 		 160 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  26.32 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  35.23 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  35.23 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  28.92 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  41.82 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  31.39 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  27.69 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3901  putative Tfp pilus assembly protein PilE  30.6 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3170  prepilin-type cleavage/methylation  27.03 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.647515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  26.98 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  37.88 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  36.78 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  39.68 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  36.23 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  29.59 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  27.27 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2575  putative Tfp pilus assembly protein PilE  32.56 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  27.13 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  30 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  30 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  34.38 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  30.3 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 131 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 131 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0706  putative Tfp pilus assembly protein PilE  31.01 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  30.99 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  26.83 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.66 
 
 		 167 aa  47.4  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0689  putative Tfp pilus assembly protein PilE  28.89 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.786204  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0666  putative major pilin subunit  36.51 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  42 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  30.16 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  30.43 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  30.15 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  25.23 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  28.28 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  28.15 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  25.23 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  27.05 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  26.23 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  38.36 
 
 		 218 aa  44.7  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  32.56 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  30.38 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  30.38 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  30.38 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  26.72 
 
 		 130 aa  44.3  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  30.65 
 
 		 167 aa  43.9  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  31.17 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  29.69 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  35.14 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  31.48 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.78 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.87 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  29.89 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  29.89 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  35.71 
 
 		 330 aa  43.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  29.17 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  30.99 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  41.46 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  29.89 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  40.28 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  34.02 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  29.89 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0879  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  32.73 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.48 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  26.77 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  33.73 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  40.28 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  33.33 
 
 		 141 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  29.49 
 
 		 150 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  39.06 
 
 		 325 aa  42.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  38.3 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  26.47 
 
 		 141 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  40.28 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  29.89 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  25.53 
 
 		 143 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  29.89 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  39.66 
 
 		 324 aa  42.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03022  general secretion pathway protein H  27.1 
 
 		 154 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  29.89 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  32.56 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.38 
 
 		 172 aa  42  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.51 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  42.59 
 
 		 323 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.68 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  29.69 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>