More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0666 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0666  putative major pilin subunit  100 
 
 		 147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  76.87 
 
 		 147 aa  243  8e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  73.1 
 
 		 148 aa  234  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3762  putative major pilin subunit  70.07 
 
 		 148 aa  214  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  59.72 
 
 		 146 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  59.72 
 
 		 146 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  59.72 
 
 		 146 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  59.72 
 
 		 146 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  59.72 
 
 		 146 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  59.72 
 
 		 146 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  60.42 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  59.03 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  60.42 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  60.42 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  59.72 
 
 		 145 aa  184  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  59.72 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  59.03 
 
 		 145 aa  183  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0778  putative major pilin subunit  62.5 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  50 
 
 		 154 aa  151  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  50 
 
 		 154 aa  151  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  50 
 
 		 154 aa  151  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  40.62 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  34.17 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  39.6 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  46.03 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  31.76 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  30.65 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  47.62 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3604  methylation site containing protein  47.22 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0981563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  47.17 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  42.17 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1879  hypothetical protein  39.52 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  34.71 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  36.84 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  42.86 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  32.5 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  32.23 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  36.15 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  30.46 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  34.04 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  44.26 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1950  type 4 major prepilin protein  40.4 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0248  type IV-A pilin protein PilA  40.4 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  42.62 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  43.1 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  46 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  48.08 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  33.33 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  32.94 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  27.83 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  32.56 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  27.83 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  30.07 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  27.83 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  50 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  27.83 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1890  hypothetical protein  38.84 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  29.2 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  34.38 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  40.98 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  37.31 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  44.64 
 
 		 165 aa  53.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  30.58 
 
 		 198 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04886  pilin  32.61 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.969324  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  33.33 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  33.8 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  48 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  31.58 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  35.79 
 
 		 207 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  27.83 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  37.88 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  35.35 
 
 		 178 aa  52  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  40.68 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  37.88 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  43.14 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  50 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  34.69 
 
 		 198 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  32.43 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  48.89 
 
 		 166 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  48 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  34.69 
 
 		 198 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  34.69 
 
 		 198 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  35.16 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0864  peptidase S49, protease IV  31.97 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  35.85 
 
 		 165 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  34.69 
 
 		 198 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  34.69 
 
 		 198 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 		 144 aa  50.8  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  38.46 
 
 		 199 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>