240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0778 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0778  putative Tfp pilus assembly protein PilE  100 
 
 		 155 aa  313  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2686  pilus assembly protein PilE  49.23 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  34.03 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0717  putative type-4 frimbrial pilin-related signal peptide protein  40.16 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0666  putative type-4 frimbrial pilin-related signal peptide protein  38.24 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal  0.345081 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  33.33 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  31.97 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  34.04 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0710  putative type-4 frimbrial pilin-related signal peptide protein  37.23 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16724  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  40 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  42.11 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  34.55 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  33.59 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  34.55 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  32.82 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  32.86 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  35.11 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  26.77 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  39.39 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  44.23 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  31.97 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  31.18 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  33.08 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  30.08 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  33.33 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.26 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  28.68 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  33.86 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  34.92 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  29.59 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  30.71 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  31.71 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  48.89 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  28.46 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  37.7 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  38.71 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2575  putative Tfp pilus assembly protein PilE  34.09 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  48.78 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  28.35 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  43.14 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  30.08 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  27.01 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  40 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  45.28 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  28.35 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  35.59 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  27.08 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0689  putative Tfp pilus assembly protein PilE  34.65 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.786204  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  36.21 
 
 		 207 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  40.68 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  34.35 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  35.94 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.4 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  40 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  40 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  29.86 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  51.02 
 
 		 130 aa  48.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 		 178 aa  48.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  32.56 
 
 		 182 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  42.19 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  36.84 
 
 		 205 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  39.13 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  24.59 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  46.51 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0706  putative Tfp pilus assembly protein PilE  33.86 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  39.71 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  39.13 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  33.62 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  34.48 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  31.67 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  28.99 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  36.23 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  38.98 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  48.65 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  35.59 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  37.76 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  38.24 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  38.33 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  50 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  26.74 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  26.74 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  26.74 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  44.64 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  32.91 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  43.1 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  31 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  54.55 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  54.55 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  36.54 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  44.9 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  44.9 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  54.55 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5684  pilus assembly protein PilE  33.06 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.148368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.92 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  44.9 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  30.77 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  45 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  44.9 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  29.89 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  29.89 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>