More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0879 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0879  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  100 
 
 
141 aa  279  9e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  42.45 
 
 
142 aa  98.6  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  42.45 
 
 
142 aa  98.2  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.29 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0745  hypothetical protein  45.07 
 
 
213 aa  58.2  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.836377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  36.67 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  45.9 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  37.08 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  37.5 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  38.2 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  41.18 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.83 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  32.86 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  32 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  50.94 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  32 
 
 
151 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  32 
 
 
151 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  32 
 
 
151 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  32 
 
 
151 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  32 
 
 
151 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.55 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  33.65 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  32 
 
 
151 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  45.31 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  45.31 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  36.73 
 
 
166 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.94 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.94 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  40.79 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  35.64 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  30.7 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.33 
 
 
169 aa  50.1  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  50.94 
 
 
163 aa  50.4  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  35.64 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  35 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  42.03 
 
 
176 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  29.25 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  34.09 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  37.18 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  42.03 
 
 
176 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  34.65 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  34.31 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  34.91 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  49.06 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.94 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  37.37 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.94 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.06 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.44 
 
 
170 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  35.64 
 
 
124 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  41.18 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  35.23 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.14 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  33.67 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  43.64 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  37.37 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1722  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  37.88 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  39.34 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  43.64 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  37 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  39.06 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0666  putative major pilin subunit  39.34 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  38.64 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  34.57 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  38.89 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  34.65 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.17 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2019  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.48 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  33.33 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  33 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  39.68 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  33 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  48.15 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  39.66 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  41.07 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  41.18 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  43.86 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45 
 
 
168 aa  47.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  43.33 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  35.29 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.07 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  52.73 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>