More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1091 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  100 
 
 		 130 aa  270  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  56.25 
 
 		 130 aa  147  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  53.44 
 
 		 130 aa  143  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  51.97 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  48.85 
 
 		 130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  52.76 
 
 		 133 aa  134  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  49.22 
 
 		 138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  49.21 
 
 		 128 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  50 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0932  type IV pilus biogenesis protein PilE  53.97 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  45 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  47.29 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  47.29 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  46.51 
 
 		 130 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  46.51 
 
 		 130 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  44.03 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  43.61 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2715  methylation  43.2 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0720544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  38.81 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  46.21 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  42.4 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  42.4 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.18 
 
 		 170 aa  93.6  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3524  type IV pilus biogenesis protein PilE  46.46 
 
 		 130 aa  91.3  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0399  general secretion pathway protein H  41.67 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  41.91 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  41.91 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  35.42 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5684  pilus assembly protein PilE  37.59 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.148368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  38.33 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2839  protein involved in methylation  43.94 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273449  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  36.92 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  38.69 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  38.69 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  36.92 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  35.97 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  37.6 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  35.11 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  35.29 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  38.33 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  36.43 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.96 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  35.82 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  34.56 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  36.03 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  35.56 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1287  type 4 fimbrial biogenesis signal peptide protein  36.05 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0957  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.76 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296711 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  36.8 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  34.48 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  52.24 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0220  pilus assembly protein  41.04 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  32.82 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  30.66 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0208  putative prepilin like protein  36.3 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0480818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  36.8 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  53.7 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  42.25 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  34.29 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  31.19 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  32.58 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  33.33 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0830  methylation site containing protein  40.31 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  29.41 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  33.33 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0865  methylation site containing protein  40.31 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0853  methylation site containing protein  40.31 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  32.33 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3102  fimbrial protein pilin  40.16 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.193045  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  60 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11830  type IV PilE-like pilus assembly protein  35.16 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3041  general secretion pathway protein H  42.28 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391226  normal  0.137984 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3424  methylation site containing protein  41.41 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  50 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  69.05 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  29.52 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  35.85 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.21 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.45 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0710  methylation site containing protein  40.62 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  39.36 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  43.14 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.42 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0193  pilus assembly protein PilE  32.17 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0854  type IV pilin, putative  40.62 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.67 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3224  type IV pilin  36.64 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0493  methylation  38.06 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  46.75 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  39.74 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  49.06 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  31.58 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3312  methylation site containing protein  40.62 
 
 		 123 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.794951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.43 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  50.88 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  78.79 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3170  prepilin-type cleavage/methylation  33.02 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.647515  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0020  PilE protein  33.54 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  28.36 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>