More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0932 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0932  type IV pilus biogenesis protein PilE  100 
 
 		 132 aa  267  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  81.82 
 
 		 132 aa  226  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  84.8 
 
 		 130 aa  223  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  76.69 
 
 		 133 aa  209  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  79.2 
 
 		 130 aa  208  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  76 
 
 		 130 aa  206  9e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  61.22 
 
 		 147 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  68.8 
 
 		 130 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  68.8 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  68.8 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  68 
 
 		 130 aa  168  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3524  type IV pilus biogenesis protein PilE  64.84 
 
 		 130 aa  163  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  56.45 
 
 		 128 aa  153  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2715  methylation  57.03 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0720544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  53.97 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  51.94 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  49.25 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  48.09 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  44.7 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  45.8 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0399  general secretion pathway protein H  47.33 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.14 
 
 		 170 aa  94.4  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5684  pilus assembly protein PilE  45.8 
 
 		 167 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.148368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  36.96 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  43.07 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  40.43 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0220  pilus assembly protein  43.48 
 
 		 140 aa  84.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  35.56 
 
 		 151 aa  84  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  35.56 
 
 		 151 aa  84  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  38.57 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0208  putative prepilin like protein  39.53 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0480818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2839  protein involved in methylation  46.32 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  42.75 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0957  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.57 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296711 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  36.62 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  36.62 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  42.06 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  34.11 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1287  type 4 fimbrial biogenesis signal peptide protein  39.72 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54364 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  36.51 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  36.51 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  34.59 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  35.71 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  35.94 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11830  type IV PilE-like pilus assembly protein  42.22 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  38.03 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  38.03 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  34.85 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  35.61 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  36.76 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  34.31 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  34.59 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  34.09 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0020  PilE protein  35.06 
 
 		 164 aa  67  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2557  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40 
 
 		 145 aa  66.6  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  34.03 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  36.3 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  32.35 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  45.83 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  35.11 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  32.5 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  38.61 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  60.78 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  30.23 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  33.8 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  30.23 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  34.59 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  50.79 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  35.34 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  36.22 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.53 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3224  type IV pilin  37.5 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  31.88 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  36.51 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.18 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  31.54 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0611  type IV pili biogenesis protein PilE  33.08 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  31.43 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.77 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2575  putative Tfp pilus assembly protein PilE  33.33 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  32.64 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0651  type IV pili biogenesis protein PilE  32.33 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.384502 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0855  pilus assembly protein  38.1 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3424  methylation site containing protein  36.43 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01136  Tfp pilus assembly protein PilE  30.23 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.62 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  62.22 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.71 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3901  putative Tfp pilus assembly protein PilE  33.86 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3102  fimbrial protein pilin  37.4 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.193045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  43.9 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  34.23 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0830  methylation site containing protein  36.8 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  38.96 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0853  methylation site containing protein  36.8 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0710  methylation site containing protein  35.66 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0865  methylation site containing protein  36.8 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.48 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>