More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3041 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3041  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 138 aa  283  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391226  normal  0.137984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  48.53 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  42.07 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3403  fimbrial biogenesis protein  45.77 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00878868 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  41.73 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  42.28 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  54.24 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  52.38 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  40.37 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  39.84 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  57.14 
 
 		 170 aa  73.6  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  38 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  60.38 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  39.62 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  56.36 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  53.12 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  36 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  43.53 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  72.09 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  56.14 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.84 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  39.81 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  43.04 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  37.5 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  37.5 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  55.56 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  44.05 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  38.13 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  45 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  38.13 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.3 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  42.39 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  51.56 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  53.45 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  38.68 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  55.36 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  53.57 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  40.23 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  37.5 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.56 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  40.91 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  44.3 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  65.91 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  41.89 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  50 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  37.04 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  50.85 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  39.51 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  41.12 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  51.56 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  45.31 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  37.78 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  54.55 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  71.79 
 
 		 196 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  54.39 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  47.54 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  35.07 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  62.79 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  40.38 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  47.69 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  35.97 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  50.68 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  43.75 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  40.4 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  48.48 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  45.16 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0230  Fimbrial protein pilin  37.37 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  40.58 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  32.39 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  51.85 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  34.65 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  43.75 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  50 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.09 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  37.27 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.44 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  52.38 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  51.72 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  67.5 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  70 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  37.93 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  70.27 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  38.24 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  75 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  38.24 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  43.84 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  67.5 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  38.24 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  52.08 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  58.14 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  47.46 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.75 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  48.33 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  38.2 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  52.08 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  48.53 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  45.16 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  52.08 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  50 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  62.5 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>