160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01325 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  100 
 
 		 122 aa  251  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  53.28 
 
 		 135 aa  130  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  54.03 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  54.03 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3224  type IV pilin  50 
 
 		 141 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  42.19 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  41.98 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  41.41 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  39.52 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  46.61 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  39.52 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  42.06 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  41.73 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  39.84 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  38.28 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  37.31 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  39.44 
 
 		 169 aa  84.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  40.8 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  42.86 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  41.27 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  37.6 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  37.6 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  38.51 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  35.42 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  36.51 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  33.33 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  41.94 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  36.72 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  40.94 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  40.94 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  39.52 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3102  fimbrial protein pilin  41.86 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.193045  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0611  type IV pili biogenesis protein PilE  36.51 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  39.23 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  36 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.3 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  38.98 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0651  type IV pili biogenesis protein PilE  35.71 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.384502 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  35.04 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.68 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  35.71 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  35.62 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  40 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  35.48 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  36.8 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  40.98 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0193  pilus assembly protein PilE  36.44 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  31.71 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  31.71 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  30.07 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  32.81 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  35.48 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0020  PilE protein  37.06 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  34.13 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0957  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.05 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296711 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  34.68 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4842  hypothetical protein  35.96 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0454526  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.76 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0028  PilE protein  39.62 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  34.68 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  34.68 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  34.11 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0853  methylation site containing protein  39.34 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0830  methylation site containing protein  39.34 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0865  methylation site containing protein  39.34 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0208  putative prepilin like protein  37.17 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0480818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0932  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.06 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  33.06 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  35.11 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  31.2 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  32.61 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5684  pilus assembly protein PilE  40.48 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.148368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0024  PilE protein  37.74 
 
 		 139 aa  57  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1287  type 4 fimbrial biogenesis signal peptide protein  33.33 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0399  general secretion pathway protein H  41.73 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  37.04 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0671  hypothetical protein  31.4 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.228298  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3524  type IV pilus biogenesis protein PilE  36.75 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  33.86 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  38.04 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0220  pilus assembly protein  35.29 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2839  protein involved in methylation  38.89 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3170  prepilin-type cleavage/methylation  46.15 
 
 		 155 aa  52  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.647515  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3424  methylation site containing protein  30.84 
 
 		 123 aa  52  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01136  Tfp pilus assembly protein PilE  30.47 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  37.35 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  31.06 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  50 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0689  putative Tfp pilus assembly protein PilE  32.52 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.786204  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0854  type IV pilin, putative  29.91 
 
 		 123 aa  50.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0710  methylation site containing protein  29.91 
 
 		 123 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0706  putative Tfp pilus assembly protein PilE  31.71 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3312  methylation site containing protein  29.91 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.794951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0855  pilus assembly protein  28.07 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  30.08 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0493  methylation  32.37 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3901  putative Tfp pilus assembly protein PilE  31.36 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2715  methylation  27.83 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0720544  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2575  putative Tfp pilus assembly protein PilE  28.15 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253595  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>