More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0671 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0671  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.228298  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  44.83 
 
 		 163 aa  133  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  46.31 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01136  Tfp pilus assembly protein PilE  40.31 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  38.81 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  39.13 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  32.82 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  34.38 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  32.09 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  33.58 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  31.85 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  31.39 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  31.85 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  29.63 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  35.92 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  37.72 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  30.7 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  31.01 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  31.01 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  31.82 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  34.96 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  32.12 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  34.59 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  33.81 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  34.15 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3224  type IV pilin  35.77 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  36.55 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  36.55 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  32.31 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  30.97 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.56 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  31.62 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  31.62 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  52 
 
 		 162 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  27.69 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  29.08 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  29.53 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3170  prepilin-type cleavage/methylation  29.46 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.647515  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  34.06 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  30.82 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  34.59 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  41.07 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  28.79 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  30.77 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  29.08 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  29.33 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0220  pilus assembly protein  34.81 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  36.14 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  30.88 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  33.1 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  32.54 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  47.27 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  44.64 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  41.67 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  32.48 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  33.33 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  33.59 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  32.59 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  45 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3102  fimbrial protein pilin  37.21 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.193045  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  45 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  32.97 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  38.24 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  38.24 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  33.33 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  32.65 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  48.15 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0399  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  32.88 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  29.71 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  41.18 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0611  type IV pili biogenesis protein PilE  32.18 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2024  hypothetical protein  37.25 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.833436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  33.72 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  54.17 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0651  type IV pili biogenesis protein PilE  32.18 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.384502 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.69 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  38.24 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5684  pilus assembly protein PilE  34.68 
 
 		 167 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.148368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  39.68 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  46 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  32.26 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  28.46 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  43.33 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  46 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  41.82 
 
 		 167 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  29.82 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  50 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  46.3 
 
 		 170 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  48.89 
 
 		 174 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  52.94 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  63.64 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  52.17 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  53.85 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  53.66 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  52.38 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  32.67 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  59.52 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  59.52 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>