62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2024 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2024  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  355  9.999999999999999e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.833436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0268  putative pilin protein PilE  32.93 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.405094  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0239  pilus assembly protein PilE  30.38 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.179125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  38.98 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3170  prepilin-type cleavage/methylation  31.03 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.647515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  35.59 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  36.36 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.88 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  35.59 
 
 		 129 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01136  Tfp pilus assembly protein PilE  36.96 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  33.33 
 
 		 129 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  26 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  35.19 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  28.81 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  28.89 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  27.12 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  24.84 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0651  type IV pili biogenesis protein PilE  31.82 
 
 		 129 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.384502 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  30.86 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0611  type IV pili biogenesis protein PilE  31.82 
 
 		 129 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  29.17 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  24.36 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  27.12 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  37.29 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  30.51 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  35.71 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  25 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  35.29 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  48.65 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  33.33 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  27.86 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  31.03 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  31.03 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  25.68 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  29.63 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  40 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  28.24 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  30.49 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  27.12 
 
 		 132 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  29.29 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  30.49 
 
 		 144 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  30.49 
 
 		 144 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  32.2 
 
 		 140 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  30.49 
 
 		 144 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  26.27 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  26.19 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  27.12 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  41.46 
 
 		 141 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  45.24 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  29.27 
 
 		 144 aa  41.2  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  30.95 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  26.92 
 
 		 147 aa  40.8  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  29.27 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  29.27 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  29.27 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  33.9 
 
 		 153 aa  41.2  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  29.27 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  32.76 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  27.14 
 
 		 153 aa  40.8  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  32.69 
 
 		 136 aa  40.8  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  32.69 
 
 		 136 aa  40.8  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  36 
 
 		 161 aa  40.8  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>