More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0268 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0268  putative pilin protein PilE  100 
 
 
157 aa  324  3e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.405094  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0239  pilus assembly protein PilE  64.43 
 
 
145 aa  165  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.179125  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2024  hypothetical protein  32.93 
 
 
173 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.833436  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  37.82 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  36.03 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  33.8 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  36.64 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  36.49 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  33.86 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  33.86 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  35.56 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  39.25 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  38.98 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  37.01 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  33.33 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  47.83 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  41.88 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.54 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  40.62 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  33.58 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  50 
 
 
140 aa  67  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3170  prepilin-type cleavage/methylation  45.76 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.647515  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  33.33 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  33.33 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  30.14 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  34.51 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  48 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  48.33 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  37.68 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2839  protein involved in methylation  39.39 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  52.73 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.57 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  53.85 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  36.88 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  54 
 
 
163 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  46.15 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  60.87 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  52.73 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  69.23 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  54.55 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  56 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  57.41 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  35.16 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  45.31 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  31.91 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  59.57 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  34.25 
 
 
169 aa  61.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  31.3 
 
 
144 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  49.21 
 
 
130 aa  61.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  75 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  48.33 
 
 
132 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  42.42 
 
 
135 aa  60.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  53.45 
 
 
149 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  41.67 
 
 
129 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  49.18 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  35.04 
 
 
163 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  30.53 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  45.31 
 
 
141 aa  60.5  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  71.79 
 
 
146 aa  60.5  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  45.16 
 
 
141 aa  60.5  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  43.75 
 
 
133 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  50 
 
 
70 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  51.85 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  64.1 
 
 
178 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  59.57 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  41.25 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  31.34 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.33 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  60.47 
 
 
182 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  67.5 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  63.41 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  65 
 
 
179 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  41.56 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  30.72 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  42.03 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0611  type IV pili biogenesis protein PilE  40 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  40.26 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  42.03 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  40 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  42.03 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  42.03 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  40.96 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  43.75 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  57.45 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  43.94 
 
 
145 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  59.52 
 
 
173 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  51.92 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  71.05 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0651  type IV pili biogenesis protein PilE  40 
 
 
129 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.384502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  55.81 
 
 
174 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  62.5 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  44.87 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  52.83 
 
 
141 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  42.03 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  48.33 
 
 
130 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  48.33 
 
 
130 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.57 
 
 
172 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.12 
 
 
165 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  62.5 
 
 
179 aa  58.2  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  37.14 
 
 
143 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>