More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0024 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0024  PilE protein  100 
 
 		 139 aa  291  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0028  PilE protein  97.84 
 
 		 140 aa  224  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  37.78 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  42.22 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  45.74 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  35.66 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  45.6 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  41.55 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  41.8 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  38.41 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  42.15 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.24 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  37.32 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  35.61 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  35.61 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  40 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  39.13 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  36.17 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  36.5 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.64 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  36.5 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  36.5 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  39.68 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  34.78 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  35.11 
 
 		 144 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  36.03 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0020  PilE protein  37.01 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  35.11 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  33.57 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  37.59 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3224  type IV pilin  42.11 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  31.43 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0493  methylation  35.61 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  35.07 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  37.41 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  35.38 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  35.71 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.96 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  31.61 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2839  protein involved in methylation  42.03 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273449  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  34.81 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  32.47 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  28 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  28 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  31.34 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  35.56 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.3 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  34.31 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  38.69 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.3 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  33.81 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.3 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  36.51 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  31.76 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0208  putative prepilin like protein  40.77 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0480818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5684  pilus assembly protein PilE  40.32 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.148368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  32.39 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3102  fimbrial protein pilin  36.97 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.193045  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  42.47 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0932  type IV pilus biogenesis protein PilE  36.23 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  37.35 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  33.33 
 
 		 149 aa  60.1  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  33.33 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0399  general secretion pathway protein H  36.69 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  43.94 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3901  putative Tfp pilus assembly protein PilE  31.91 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0865  methylation site containing protein  37.5 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0853  methylation site containing protein  37.5 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0830  methylation site containing protein  37.5 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  32.2 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  41.94 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3041  general secretion pathway protein H  35.29 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391226  normal  0.137984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  31.82 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  36.71 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0193  pilus assembly protein PilE  37.01 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  36.43 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  41.94 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  34.88 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0854  type IV pilin, putative  38.76 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  41.67 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  31.06 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  43.55 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3170  prepilin-type cleavage/methylation  33.91 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.647515  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0706  putative Tfp pilus assembly protein PilE  31.97 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  43.1 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0689  putative Tfp pilus assembly protein PilE  31.45 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.786204  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  30.77 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.67 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  31.11 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0855  pilus assembly protein  40 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  40 
 
 		 149 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0651  type IV pili biogenesis protein PilE  31.06 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.384502 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  39.02 
 
 		 162 aa  52  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2575  putative Tfp pilus assembly protein PilE  30.56 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  40.68 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  40 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  39.06 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0611  type IV pili biogenesis protein PilE  31.62 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.94 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.44 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>