141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0500 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  100 
 
 		 218 aa  450  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  58.41 
 
 		 222 aa  252  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  38.79 
 
 		 187 aa  88.6  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  28.21 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  32.82 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  40 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  37.82 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.6 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  54.84 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  36.36 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  54.1 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  35.85 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  54.1 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.17 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  30.86 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  27.32 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.92 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  54.1 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  52.46 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  52.46 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.98 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  42.22 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  48.48 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.88 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  25.74 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  37.5 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2535  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.87 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.99 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35.51 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  32.14 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  42.86 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  25.74 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  31.62 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  36.46 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  30.88 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.69 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.11 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.71 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  32.26 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  26.67 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  35.35 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  36.14 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  26.03 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  29.58 
 
 		 166 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0485  methylation  38.78 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  28.26 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  32.26 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2534  N-terminal methylation site-containing protein  28.89 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2834  protein involved in methylation  32.14 
 
 		 171 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  26.11 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  23.89 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.63 
 
 		 164 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0709  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  30.09 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.63 
 
 		 164 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.63 
 
 		 164 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  26.39 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.96 
 
 		 164 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  32.67 
 
 		 170 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  29.7 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.91 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  32.99 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  38.03 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0665  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  31.86 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.956301  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  37.65 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  39.39 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  32.61 
 
 		 172 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  39.13 
 
 		 179 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  45.61 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  28.68 
 
 		 171 aa  49.3  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  30.3 
 
 		 163 aa  48.9  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.07 
 
 		 178 aa  49.3  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  32.29 
 
 		 186 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  36.76 
 
 		 177 aa  48.5  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  28.57 
 
 		 170 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  28.57 
 
 		 170 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  28.57 
 
 		 170 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  29.79 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 161 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004287  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  42.11 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.9 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  28.44 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  41.86 
 
 		 136 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2479  pilin-like protein  35.9 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209449  hitchhiker  0.0000256314 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.55 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  32.26 
 
 		 157 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.32 
 
 		 177 aa  46.2  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  34.21 
 
 		 167 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  42.86 
 
 		 147 aa  45.8  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  32.74 
 
 		 167 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  31.11 
 
 		 160 aa  45.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  40.32 
 
 		 190 aa  45.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.56 
 
 		 187 aa  45.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  40 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1384  fimbrial biogenesis protein  25.2 
 
 		 164 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.168846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  28.41 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  37.04 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.81 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  31.91 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  24.27 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  34.85 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>