More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2535 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2535  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  100 
 
 		 193 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  74.86 
 
 		 194 aa  292  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  56 
 
 		 187 aa  194  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  44.07 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  43.2 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2534  N-terminal methylation site-containing protein  43.65 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  40.46 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  33.52 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.13 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.79 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  38.3 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  33.52 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35.71 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  31.43 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  36.57 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  30.36 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.12 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.72 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  30.29 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  30.29 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  30.29 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  30.46 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  31.17 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.55 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.55 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  36.36 
 
 		 172 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  39.56 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36.7 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.39 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.48 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  29.31 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  29.41 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.84 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.7 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  25.86 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  26.29 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.49 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.71 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  29.26 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1381  hypothetical protein  29.21 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.55 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  43.08 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  50 
 
 		 145 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.89 
 
 		 222 aa  62  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  50 
 
 		 145 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  38.89 
 
 		 144 aa  62  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.77 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  29.65 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  32.04 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  26.46 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  33.65 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  40.7 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  48.39 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.93 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  33.05 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004287  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  40.85 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  29.38 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  29.14 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  34.48 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  40.3 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  28.98 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  40.3 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36.96 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.37 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  31.15 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.01 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  39.64 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.89 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.82 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  38.81 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  29.52 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  36.36 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.54 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  41.1 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  33.68 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0485  methylation  29.03 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.89 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  33.68 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  32.14 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0489  methylation  29.95 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  42.42 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  33.02 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  39.02 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  40.91 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  39.34 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  30.3 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  39.68 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3107  N-terminal methylation site  29.86 
 
 		 143 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  33.33 
 
 		 157 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  36.07 
 
 		 161 aa  52  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.26 
 
 		 164 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  22.54 
 
 		 169 aa  51.6  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.26 
 
 		 164 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.26 
 
 		 164 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3897  Tfp pilus assembly protein FimT-like  28.74 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3169  prepilin-type cleavage/methylation  34.58 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  34.83 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 154 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  32.97 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  32.97 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>