216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0485 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0485  methylation  100 
 
 		 178 aa  362  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  36 
 
 		 174 aa  95.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  35.39 
 
 		 200 aa  88.2  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  31.58 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  45.98 
 
 		 171 aa  85.1  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.75 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.14 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  45.12 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  36.8 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  41.28 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  49.3 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.59 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  32.24 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.14 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  52.24 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  50.75 
 
 		 144 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  37.36 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  50.75 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  37.36 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  37.36 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.21 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  33.87 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  30.3 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  32.92 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  31.36 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  39.22 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2834  protein involved in methylation  36.59 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  46.48 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  38.78 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  31.95 
 
 		 162 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  34.38 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  30.16 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  34.52 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  34.52 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  45 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  33.33 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.57 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  29.69 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  36.46 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  37.76 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1707  putative type IV pilus assembly protein FimT  32.03 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.45 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  38.64 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  26.55 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1769  fimbrial protein FimT  31.25 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  33.08 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  26.38 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.48 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.29 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  29.31 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.83 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  37.5 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01320  pre-pilin like leader sequence  33.9 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0857  general secretion pathway protein H  35.29 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  31.46 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  33.67 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2535  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.03 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  28.46 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  27.42 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  25.42 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  28.23 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004287  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  31.52 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1381  hypothetical protein  31.78 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722593  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  25.44 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  29.46 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  31.61 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  23.95 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  37.04 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0562  putative fimT protein  40.62 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000705405  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  30.85 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3169  prepilin-type cleavage/methylation  33.78 
 
 		 190 aa  50.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2534  N-terminal methylation site-containing protein  26.52 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1621  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  39.68 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000506995  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  38.33 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.87 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  37.29 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0378  hypothetical protein  28.57 
 
 		 217 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913387  hitchhiker  0.000267093 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.67 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  27.47 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0400  N-terminal methylation site  28.85 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  35 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.33 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0777  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  30.95 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  33.61 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.84 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  36.23 
 
 		 192 aa  48.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03018  hypothetical protein  26.32 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  22.29 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0319  hypothetical protein  35 
 
 		 199 aa  48.1  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.380813  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0709  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  34.57 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.39 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.39 
 
 		 170 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.07 
 
 		 187 aa  47.8  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0716  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  27.98 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  28.74 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  36.07 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  35 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  31.9 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>