74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0385 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  100 
 
 		 184 aa  383  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004287  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  68.24 
 
 		 168 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01137  Tfp pilus assembly protein FimT  38.83 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  43.18 
 
 		 171 aa  136  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  32.96 
 
 		 192 aa  101  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  29.82 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0679  type IV pilin  25.86 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.639618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.64 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  39.19 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  26.74 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  37.88 
 
 		 192 aa  52  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  42.42 
 
 		 168 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  40.3 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  42.11 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  32 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  28.36 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2905  Tfp pilus assembly protein FimT  29.3 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  25.15 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  30.11 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  45.61 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  26.36 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  27.21 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  38.71 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  27.21 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2929  general secretion pathway protein H  25.28 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  25.95 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1037  hypothetical protein  24.56 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0985  hypothetical protein  24.56 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.323968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  33.8 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  25 
 
 		 182 aa  48.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  23.17 
 
 		 169 aa  47.8  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.24 
 
 		 194 aa  47.8  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  39.34 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  38.03 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  25.3 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  38.98 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  25.3 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3194  hypothetical protein  23.12 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  33.33 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32 
 
 		 214 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.82 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  37.29 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  24.7 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2534  N-terminal methylation site-containing protein  28.21 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  24.63 
 
 		 144 aa  45.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  29.76 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  36.49 
 
 		 157 aa  45.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  25.95 
 
 		 157 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  36.07 
 
 		 145 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2344  hypothetical protein  35.94 
 
 		 164 aa  44.3  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  34.25 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  24.11 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  38.6 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  35.94 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2678  hypothetical protein  30.93 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000820261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  36.07 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  37.93 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0962  N-terminal methylation  37.25 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  39.29 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  31.75 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.39 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  36.07 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  22.29 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.53 
 
 		 177 aa  42  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  21.88 
 
 		 170 aa  42  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  34.48 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  31.08 
 
 		 178 aa  41.6  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  30.65 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  32.2 
 
 		 163 aa  41.2  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2881  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  38.81 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2535  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.3 
 
 		 193 aa  40.8  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  36.54 
 
 		 186 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  36.67 
 
 		 182 aa  40.8  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>