More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2881 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2881  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  100 
 
 		 204 aa  418  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  36.36 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  39.02 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  38.1 
 
 		 175 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  44.44 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  36.61 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  41.89 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  34.13 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  38.46 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  48.21 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  30.77 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  42.35 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  54.84 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  51.72 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  30.49 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  31.95 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  48.28 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  52.63 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  50.85 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  38.3 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  57.14 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  48.21 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  37.38 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  28.66 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  42.25 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  46.77 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  48.21 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  41.1 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  45.59 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  49.12 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  33 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  47.37 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  45.59 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  43.33 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  46.55 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  37.19 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  46.43 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  47.54 
 
 		 144 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  46.43 
 
 		 145 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  36.23 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  38.81 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01137  Tfp pilus assembly protein FimT  38.1 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  32.41 
 
 		 157 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  46.55 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  44.93 
 
 		 166 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  34.94 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  35.96 
 
 		 157 aa  52  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  44.64 
 
 		 144 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  44.93 
 
 		 166 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0400  N-terminal methylation site  52.86 
 
 		 162 aa  51.6  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  44.64 
 
 		 144 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  41.94 
 
 		 178 aa  51.6  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  36.36 
 
 		 163 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  44 
 
 		 144 aa  51.6  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0962  N-terminal methylation  37.1 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  26.88 
 
 		 155 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  39.29 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  27.78 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  36.63 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  43.1 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  43.1 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  42.86 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5685  Type IV pilus transmembrane protein, FimT  35.24 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.695953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3169  prepilin-type cleavage/methylation  37.1 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004287  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  38.71 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  37.04 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  42.55 
 
 		 150 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.62 
 
 		 168 aa  49.7  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  26.14 
 
 		 160 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  46.15 
 
 		 168 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  44.68 
 
 		 146 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  26.14 
 
 		 160 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  41.38 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  39.39 
 
 		 144 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  39.39 
 
 		 144 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.1 
 
 		 168 aa  48.9  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0134  hypothetical protein  32.18 
 
 		 139 aa  48.5  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  40 
 
 		 142 aa  48.5  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.65 
 
 		 173 aa  48.5  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  40.68 
 
 		 154 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  42.55 
 
 		 165 aa  48.5  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  47.27 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  32.47 
 
 		 157 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  38.98 
 
 		 171 aa  48.5  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  52.27 
 
 		 164 aa  48.1  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  45.45 
 
 		 150 aa  48.1  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  40.68 
 
 		 154 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  42.11 
 
 		 170 aa  48.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  45 
 
 		 198 aa  48.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  28.26 
 
 		 169 aa  48.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  27.71 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  42.22 
 
 		 147 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  36.96 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2534  N-terminal methylation site-containing protein  58.06 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  57.14 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  46.43 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  39.73 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  45 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  41.82 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>