131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3029 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  100 
 
 		 155 aa  307  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  72.96 
 
 		 160 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  72.33 
 
 		 160 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  56.63 
 
 		 163 aa  175  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  53.01 
 
 		 163 aa  173  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  52.44 
 
 		 161 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  61.39 
 
 		 162 aa  153  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  52.83 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  50.31 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  52.2 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  52.2 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  52.2 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  40.72 
 
 		 177 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.01 
 
 		 178 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  41.25 
 
 		 170 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  36.59 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  35.98 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  35.84 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  35.98 
 
 		 170 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  35.62 
 
 		 170 aa  97.8  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.41 
 
 		 170 aa  97.4  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.57 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  36.48 
 
 		 170 aa  94.7  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  36.48 
 
 		 170 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  33.33 
 
 		 173 aa  90.5  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.6 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.33 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.48 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  32.3 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  31.68 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  31.68 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.49 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  30.43 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  28.85 
 
 		 188 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  25.75 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  26.09 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  25.83 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  31 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  23.4 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.22 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2534  N-terminal methylation site-containing protein  31.68 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.62 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  32.37 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  32.37 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  32.37 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  31.62 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  39.08 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  26.14 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1219  putative type IV pilus biogenesis protein  27.1 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  33.77 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  24.16 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  30.3 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.45 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.57 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  30.52 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  30.52 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  29.2 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  35.8 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  28.69 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  35.29 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  29.55 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.93 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.59 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  42.11 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  27.5 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  37.5 
 
 		 201 aa  52.4  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  25.42 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  28.24 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  25.43 
 
 		 194 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  39.29 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.91 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0607  type IV pili biogenesis protein FimT, putative  24.32 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  31.58 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  26.9 
 
 		 206 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  31.58 
 
 		 192 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  27.94 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  30.99 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3385  type IV pilin protein, putative  34.18 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0651  methylation site containing protein  30.14 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  27.21 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  30.77 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.12 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  32.91 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  23.78 
 
 		 186 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  32.91 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  28.23 
 
 		 200 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  27.82 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  32.43 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  23.84 
 
 		 179 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  22.88 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  32.79 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  29.58 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  28.57 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.1 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  24.57 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.77 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  34.29 
 
 		 199 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  33.82 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0648  hypothetical protein  24 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5000  hypothetical protein  27.91 
 
 		 215 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>