47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1219 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1219  putative type IV pilus biogenesis protein  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  44.69 
 
 		 208 aa  143  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  35.98 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  35.37 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  35.37 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  35.9 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  35.26 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  32.32 
 
 		 170 aa  96.7  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  35.26 
 
 		 170 aa  95.1  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.33 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.1 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.91 
 
 		 169 aa  85.9  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.17 
 
 		 170 aa  84.3  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.7 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.57 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.65 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.85 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.22 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.92 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.92 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.21 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  30.52 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  30.52 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  28.82 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  29.38 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.92 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.92 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.92 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  29.3 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.92 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.39 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  26.58 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  27.1 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  23.66 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2556  Tfp pilus assembly protein FimT-like  31.33 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  24.84 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.71 
 
 		 194 aa  52.4  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  32.37 
 
 		 162 aa  52  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3169  prepilin-type cleavage/methylation  25.7 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01320  pre-pilin like leader sequence  30.21 
 
 		 157 aa  47.8  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.4 
 
 		 194 aa  47.8  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  25.57 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  25.9 
 
 		 203 aa  45.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  24.71 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  22.42 
 
 		 171 aa  45.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.19 
 
 		 173 aa  44.3  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  25.41 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>