123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3919 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1219  putative type IV pilus biogenesis protein  44.69 
 
 		 180 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  40.96 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  41.42 
 
 		 170 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  40.36 
 
 		 170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  40.83 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  40.83 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  39.26 
 
 		 170 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  40.36 
 
 		 170 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  39.76 
 
 		 170 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  36.84 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  36.81 
 
 		 169 aa  104  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  35.12 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.35 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  36.75 
 
 		 170 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.5 
 
 		 169 aa  99.4  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  33.54 
 
 		 173 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.54 
 
 		 178 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.81 
 
 		 151 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.93 
 
 		 177 aa  85.1  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  29.51 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  30.12 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  30.25 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  25.77 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.67 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.59 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  29.17 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3169  prepilin-type cleavage/methylation  27.22 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  39.33 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  25.58 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  39.33 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  39.33 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  39.33 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.19 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  31.14 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  28.12 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  28.03 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  28.83 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  27.39 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  25.75 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  29.09 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.49 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  26.46 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  26.9 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  31.21 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  27.81 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0378  hypothetical protein  24.29 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913387  hitchhiker  0.000267093 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.99 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  30 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.61 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  27.06 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  38.82 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2965  Tfp pilus assembly protein FimT  26.55 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.108298 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  31.54 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  26.03 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2556  Tfp pilus assembly protein FimT-like  26.37 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  36.26 
 
 		 144 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  36.26 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  26.03 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.65 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  35.16 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  26.71 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  38.82 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  26.98 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  26.22 
 
 		 171 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.33 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  25.86 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.75 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  40 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  25.33 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  35.56 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2665  methylation  32 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4555  type IV pili biogenesis protein FimT  23.08 
 
 		 163 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.691315  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  24.05 
 
 		 166 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  34.07 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.47 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  38.57 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  22.78 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.97 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  37.14 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  26.25 
 
 		 162 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  32.17 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  22.16 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  38.89 
 
 		 172 aa  46.6  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  40 
 
 		 167 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  24.86 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  33.8 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.77 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  30.53 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.78 
 
 		 162 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  41.3 
 
 		 168 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  47.62 
 
 		 141 aa  45.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  35.53 
 
 		 145 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  43.4 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  46.15 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  38.46 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  50 
 
 		 128 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>