31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2965 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2965  Tfp pilus assembly protein FimT  100 
 
 		 181 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.108298 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.22 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.22 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.22 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  23.84 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.3 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.07 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  26.55 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.59 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.59 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.59 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.03 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.7 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  23.08 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.33 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  26.38 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.01 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  26.38 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  26.38 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  31.58 
 
 		 160 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  22.94 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.54 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  26.9 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  30.85 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  31.58 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.17 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0963  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.62 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.57 
 
 		 151 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.16 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  31.18 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.15 
 
 		 162 aa  40.8  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>