56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4555 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4555  type IV pili biogenesis protein FimT  100 
 
 		 163 aa  329  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.691315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0607  type IV pili biogenesis protein FimT, putative  67.5 
 
 		 160 aa  201  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0653  type IV pili biogenesis protein FimT  67.7 
 
 		 161 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.679722  normal  0.506575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0648  hypothetical protein  65.62 
 
 		 160 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  33.53 
 
 		 184 aa  104  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  31.36 
 
 		 166 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  31.14 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  28.1 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  26.92 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0489  methylation  31.76 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.35 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.75 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.75 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  22.94 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.23 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  25 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  28.12 
 
 		 182 aa  52  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  20.99 
 
 		 192 aa  50.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  23.17 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  28 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  30.85 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.27 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  27.19 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.24 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  27.61 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.93 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.29 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  28.4 
 
 		 201 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.52 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  25.48 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  23.95 
 
 		 194 aa  48.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  25.48 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.67 
 
 		 170 aa  48.1  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  23.49 
 
 		 172 aa  47.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.06 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.06 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.06 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.78 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  26.44 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  24.36 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  23.03 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  24.26 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  22.22 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  26.72 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  23.23 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  27.63 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.39 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  22.56 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  25.44 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  22.29 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.14 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  31.58 
 
 		 182 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  31.17 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  21.52 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  21.95 
 
 		 170 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  21.95 
 
 		 170 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>