115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0685 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  100 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  95.16 
 
 		 186 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3897  Tfp pilus assembly protein FimT-like  78.07 
 
 		 187 aa  270  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  67.91 
 
 		 187 aa  249  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  45.86 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  46.86 
 
 		 186 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1381  hypothetical protein  48.65 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722593  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  45.14 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2073  hypothetical protein  47.43 
 
 		 186 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0836  hypothetical protein  47.43 
 
 		 186 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2670  hypothetical protein  47.43 
 
 		 186 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3232  putative type IV pilus protein  47.43 
 
 		 186 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1940  hypothetical protein  47.43 
 
 		 186 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3246  hypothetical protein  46.55 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3194  putative type IV pilus protein  46.55 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  34.58 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  25.33 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  37.23 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  37.04 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  40 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  37.14 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.29 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  31.25 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  31.21 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  37.37 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  43.48 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.36 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.69 
 
 		 218 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.25 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  35.23 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.36 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  35.96 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  36.67 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.52 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  31.18 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0400  N-terminal methylation site  26.63 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.26 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  29.66 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.27 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.1 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36.36 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  29.37 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  29.37 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  40.3 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.57 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2535  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.24 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  34.12 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.18 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  38.71 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  33.7 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  40.28 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  38.71 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.86 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.56 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  40.28 
 
 		 144 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.93 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.09 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  38.71 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.31 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  23.78 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  28.99 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.33 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  31 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  36.36 
 
 		 162 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  32.26 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.78 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.28 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  31 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  36.71 
 
 		 190 aa  47.8  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  37.14 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  38.89 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.71 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.71 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.71 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  32.26 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  24.56 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  26.52 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  27.71 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  23.48 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.28 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  38.03 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0857  general secretion pathway protein H  29.37 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.95 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  40 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  23.12 
 
 		 173 aa  45.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  24.75 
 
 		 222 aa  45.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3107  N-terminal methylation site  34.65 
 
 		 143 aa  45.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  26.23 
 
 		 203 aa  44.7  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  35.82 
 
 		 163 aa  45.1  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2834  protein involved in methylation  30.68 
 
 		 171 aa  44.7  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  23.03 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  29.2 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  23.84 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  23.84 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  23.81 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.27 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  39.06 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0709  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  29.09 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  25 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0665  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  28.83 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.956301  normal  0.276525 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>