67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_1940 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0836  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  351  4e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2073  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  351  4e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2670  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  351  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3232  putative type IV pilus protein  100 
 
 
186 aa  351  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1940  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  351  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3194  putative type IV pilus protein  98.92 
 
 
186 aa  347  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3246  hypothetical protein  98.92 
 
 
186 aa  347  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1381  hypothetical protein  81.62 
 
 
186 aa  278  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722593  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  53.98 
 
 
186 aa  184  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  54.8 
 
 
186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  50.28 
 
 
186 aa  168  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  44.75 
 
 
187 aa  140  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3897  Tfp pilus assembly protein FimT-like  47.19 
 
 
187 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  45.91 
 
 
186 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  43.71 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.48 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.33 
 
 
194 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.27 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  32.38 
 
 
163 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.72 
 
 
170 aa  55.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  25.18 
 
 
192 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.39 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  31.03 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.85 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  28.88 
 
 
174 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  28.85 
 
 
161 aa  52  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  35.64 
 
 
182 aa  52  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.26 
 
 
164 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  36.26 
 
 
188 aa  51.2  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  27.65 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.2 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2535  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.98 
 
 
193 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.11 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  26.77 
 
 
171 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  39.34 
 
 
162 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  28.25 
 
 
191 aa  48.1  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.86 
 
 
162 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  23.86 
 
 
170 aa  48.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  27.74 
 
 
192 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.7 
 
 
164 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.7 
 
 
164 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.7 
 
 
164 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  25.89 
 
 
170 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.01 
 
 
172 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  28 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  29.6 
 
 
175 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  27.74 
 
 
192 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  21.47 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.85 
 
 
222 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.32 
 
 
173 aa  45.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.2 
 
 
168 aa  45.1  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3169  prepilin-type cleavage/methylation  25.99 
 
 
190 aa  44.7  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0400  N-terminal methylation site  26.32 
 
 
162 aa  44.7  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  22.73 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  20.81 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3107  N-terminal methylation site  32.08 
 
 
143 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.78 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  21.71 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  27.42 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  32.76 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  27.08 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  27.08 
 
 
160 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.03 
 
 
170 aa  41.6  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.33 
 
 
169 aa  41.6  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  28.42 
 
 
172 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.34 
 
 
195 aa  40.8  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  28.65 
 
 
171 aa  41.2  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>