97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3107 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3107  N-terminal methylation site  100 
 
 		 143 aa  289  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  36.09 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  33.56 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  34.62 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.91 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.38 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  35.54 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  33.91 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  36.75 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  27.52 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.93 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  37.84 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  28.85 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.81 
 
 		 187 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1381  hypothetical protein  30.33 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722593  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.45 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  40.48 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  27.7 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2535  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.38 
 
 		 193 aa  52.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  29.22 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35.04 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  43.33 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  35.05 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2534  N-terminal methylation site-containing protein  30.87 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  30.43 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  29.46 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.63 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  37.68 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.19 
 
 		 186 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  30.47 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  32.11 
 
 		 147 aa  50.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  41.07 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  39.19 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  37.11 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  30.11 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  24.76 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0400  N-terminal methylation site  30.99 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.3 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01320  pre-pilin like leader sequence  33.59 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  49.09 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  41.07 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  35.14 
 
 		 201 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  39.29 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  27.48 
 
 		 179 aa  47.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  24.82 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3385  type IV pilin protein, putative  42.59 
 
 		 172 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  26.62 
 
 		 192 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  27.59 
 
 		 192 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.05 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.45 
 
 		 177 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  27.59 
 
 		 192 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.62 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.62 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.62 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  25 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  38.18 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  24.81 
 
 		 200 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  36.99 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  34.29 
 
 		 203 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.21 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  28.57 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3246  hypothetical protein  33.06 
 
 		 186 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  41.38 
 
 		 222 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  27.52 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3194  putative type IV pilus protein  33.06 
 
 		 186 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  35.9 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  45.45 
 
 		 199 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.77 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  37.18 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  29.6 
 
 		 177 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  35.9 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.33 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  28.37 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.67 
 
 		 194 aa  43.5  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  32 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.51 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0485  methylation  30.56 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2073  hypothetical protein  32.23 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  28.99 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0836  hypothetical protein  32.23 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  34.55 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1940  hypothetical protein  32.23 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3232  putative type IV pilus protein  32.23 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  34.55 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.68 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2670  hypothetical protein  32.23 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  26.58 
 
 		 160 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.92 
 
 		 170 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3897  Tfp pilus assembly protein FimT-like  30.5 
 
 		 187 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  26.58 
 
 		 160 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.27 
 
 		 169 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  24.24 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2674  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000300663 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  28.75 
 
 		 195 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  28.75 
 
 		 195 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  26.67 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>