31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1037 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0985  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.323968  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1037  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3237  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  291  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.680138  normal  0.470977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3820  hypothetical protein  54.49 
 
 		 169 aa  169  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  normal  0.266235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3194  hypothetical protein  46.2 
 
 		 163 aa  142  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3013  hypothetical protein  38.61 
 
 		 163 aa  107  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3395  hypothetical protein  41.61 
 
 		 167 aa  94  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114024  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0908  hypothetical protein  39.39 
 
 		 167 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3163  hypothetical protein  35.1 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3326  hypothetical protein  35.1 
 
 		 156 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0233532 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3146  hypothetical protein  35.1 
 
 		 156 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3212  hypothetical protein  35.1 
 
 		 156 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3226  hypothetical protein  35.1 
 
 		 156 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0150572 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0889  hypothetical protein  31.33 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3036  hypothetical protein  31.33 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2973  hypothetical protein  31.33 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237363  decreased coverage  0.00343665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3146  hypothetical protein  31.33 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2972  hypothetical protein  31.33 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0865  conserved hypothetical protein  31.33 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4091  hypothetical protein  31.33 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0320835  normal  0.410981 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02674  hypothetical protein  31.33 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.164339  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3268  hypothetical protein  31.51 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0660732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02635  hypothetical protein  31.33 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  24.56 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  22.22 
 
 		 172 aa  44.7  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.63 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0679  type IV pilin  23.78 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.639618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  30.49 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  33.33 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0778  putative Tfp pilus assembly protein PilE  28.92 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03018  hypothetical protein  22.02 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>