25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2973 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0865  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3036  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2973  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237363  decreased coverage  0.00343665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0889  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3146  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2972  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02635  hypothetical protein  99.36 
 
 		 156 aa  320  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02674  hypothetical protein  99.36 
 
 		 156 aa  320  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.164339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4091  hypothetical protein  98.08 
 
 		 156 aa  315  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0320835  normal  0.410981 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3163  hypothetical protein  66.45 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3326  hypothetical protein  66.45 
 
 		 156 aa  197  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0233532 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3146  hypothetical protein  66.45 
 
 		 156 aa  197  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3212  hypothetical protein  66.45 
 
 		 156 aa  197  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3226  hypothetical protein  66.45 
 
 		 156 aa  197  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0150572 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3268  hypothetical protein  57.14 
 
 		 154 aa  183  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0660732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3395  hypothetical protein  38.71 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114024  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0908  hypothetical protein  38.06 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3820  hypothetical protein  38.56 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  normal  0.266235 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3013  hypothetical protein  35.17 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3194  hypothetical protein  31.54 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1037  hypothetical protein  31.33 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0985  hypothetical protein  31.33 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.323968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3237  hypothetical protein  30.47 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.680138  normal  0.470977 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  20.5 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  27.4 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>