37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03018 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03018  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  383  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  27.71 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  24.57 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0962  N-terminal methylation  26.37 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  33.33 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  25.58 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  31.37 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  37.5 
 
 		 138 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  27.19 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  27.04 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.17 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  31.17 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  25.57 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  25.57 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  29.87 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  32.65 
 
 		 142 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  42.86 
 
 		 135 aa  42.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.43 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  36.36 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  36.36 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  36.36 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  25.14 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  44.19 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  40.54 
 
 		 148 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  26.42 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  65.38 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  25 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1122  hypothetical protein  26.42 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.711782  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  52.94 
 
 		 169 aa  42  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0985  hypothetical protein  22.02 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.323968  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  29.87 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1037  hypothetical protein  22.02 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  43.64 
 
 		 144 aa  41.2  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  26 
 
 		 145 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  26.67 
 
 		 157 aa  41.2  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  32.26 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  35.29 
 
 		 221 aa  40.8  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>