23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3237 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0985  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  291  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.323968  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1037  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  291  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3237  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  286  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.680138  normal  0.470977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3820  hypothetical protein  52.17 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  normal  0.266235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3194  hypothetical protein  44.6 
 
 		 163 aa  115  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3013  hypothetical protein  39.71 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3395  hypothetical protein  39.13 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114024  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0908  hypothetical protein  37.32 
 
 		 167 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3163  hypothetical protein  36.61 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3326  hypothetical protein  36.61 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0233532 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3146  hypothetical protein  36.61 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3226  hypothetical protein  36.61 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0150572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3212  hypothetical protein  36.61 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3036  hypothetical protein  30.47 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4091  hypothetical protein  30.65 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0320835  normal  0.410981 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2973  hypothetical protein  30.47 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237363  decreased coverage  0.00343665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0889  hypothetical protein  30.47 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3146  hypothetical protein  30.47 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2972  hypothetical protein  30.47 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0865  conserved hypothetical protein  30.47 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02674  hypothetical protein  30.47 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.164339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02635  hypothetical protein  30.47 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3268  hypothetical protein  31.67 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0660732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>