108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1384 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1384  fimbrial biogenesis protein  100 
 
 		 164 aa  325  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.168846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  35.37 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  35.37 
 
 		 195 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  36.02 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.93 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  32.37 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.19 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  30.19 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.77 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  26.63 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.74 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  38.38 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  27.88 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  29.56 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  29.56 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  30.72 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  32.93 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.33 
 
 		 194 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.93 
 
 		 195 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0562  putative fimT protein  32.37 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000705405  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1621  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  31.65 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000506995  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  25.93 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  31.06 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  28.32 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.67 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.54 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  39.58 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  40.45 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.67 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  35.37 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  33.04 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  33.04 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.5 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  29.11 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.67 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  25.88 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01320  pre-pilin like leader sequence  29.11 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  33.75 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  28.1 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.17 
 
 		 218 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  33.96 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  34.48 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0963  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  25.37 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  38.2 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2562  uridylate kinase  40 
 
 		 204 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  26.19 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.67 
 
 		 214 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  24.86 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  28.85 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  29.1 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  27.33 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2834  protein involved in methylation  40.62 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.5 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  24.71 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.33 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.11 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  37.66 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.14 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  29.63 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  26.43 
 
 		 222 aa  48.5  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  37.88 
 
 		 191 aa  48.5  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  37.84 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  37.84 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  28.31 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0400  N-terminal methylation site  33.33 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  37.35 
 
 		 175 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.52 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  28.93 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  34.21 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  25.87 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  28.4 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  26.95 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  24.11 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  32.76 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  35 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  35 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  35 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1769  fimbrial protein FimT  23.94 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  26.74 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.75 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  32.93 
 
 		 222 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2965  Tfp pilus assembly protein FimT  28.83 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.108298 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  23.03 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1707  putative type IV pilus assembly protein FimT  23.24 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36.71 
 
 		 168 aa  44.7  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.75 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0485  methylation  30.33 
 
 		 178 aa  44.3  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  36.49 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1381  hypothetical protein  31 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722593  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.18 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  32.5 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01137  Tfp pilus assembly protein FimT  40.74 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.75 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  34.92 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01373  fimbrial biogenesis protein  37.25 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  30.3 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  30.3 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  31.82 
 
 		 144 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>