68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0717 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0717  putative type-4 frimbrial pilin-related signal peptide protein  100 
 
 		 143 aa  287  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0666  putative type-4 frimbrial pilin-related signal peptide protein  46.81 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal  0.345081 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0710  putative type-4 frimbrial pilin-related signal peptide protein  45.39 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16724  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2686  pilus assembly protein PilE  43.65 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  32 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0778  putative Tfp pilus assembly protein PilE  40.16 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  32.43 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  29.3 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  30.34 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  30.37 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0855  pilus assembly protein  30.28 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  27.34 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  26.62 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  28.86 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  42.37 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  31.69 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  29.37 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2575  putative Tfp pilus assembly protein PilE  34.42 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  40.68 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.23 
 
 		 170 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  30.34 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  27.54 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  27.54 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  30.94 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  39.66 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  28.24 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  37.7 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  30.14 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  25.87 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  24.36 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  31.4 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  27.97 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3901  putative Tfp pilus assembly protein PilE  30.26 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  29.71 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  25.17 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0689  putative Tfp pilus assembly protein PilE  33.09 
 
 		 151 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.786204  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  25.9 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  31.34 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.29 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.92 
 
 		 165 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0706  putative Tfp pilus assembly protein PilE  32.26 
 
 		 151 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0651  type IV pili biogenesis protein PilE  36.78 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.384502 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  27.06 
 
 		 144 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  29.51 
 
 		 130 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  27.04 
 
 		 162 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  30.59 
 
 		 149 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0611  type IV pili biogenesis protein PilE  36.78 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  34.44 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  30.59 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  27.2 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  38.67 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  28.68 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  26.92 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  31.67 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  36.92 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  27.38 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  28.05 
 
 		 151 aa  40  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.38 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  26.83 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  26.83 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.59 
 
 		 151 aa  40  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  28.05 
 
 		 151 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  28.05 
 
 		 151 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  26.83 
 
 		 144 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  28.05 
 
 		 151 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  28.05 
 
 		 151 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>