More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0897 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  100 
 
 		 118 aa  230  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  54.7 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  35.04 
 
 		 159 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  51.52 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  42.67 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  42.67 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.09 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  36.59 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  34.15 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2926  ComG operon protein 3  32.29 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.972463  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  43.33 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  35 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  45.68 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3594  hypothetical protein  38.14 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  36 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  45.59 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  35.53 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  52.5 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  37.17 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  48 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  40.68 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  43.64 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  34.55 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  55 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  55 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  46.43 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  75 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  41.38 
 
 		 178 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  36.73 
 
 		 201 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  71.43 
 
 		 179 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2094  hypothetical protein  43.24 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.548773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.75 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  39.24 
 
 		 205 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  48.78 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  52.94 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  36.79 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  48.78 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  48.78 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  34.51 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  42.67 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  38.33 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  48.78 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  35.05 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  48.78 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  37.93 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  29.67 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  48.78 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  48.78 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  39.24 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  42.19 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  36 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  38.33 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  37.62 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  37.62 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  37.62 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  48.98 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.64 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  37.62 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  39.24 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  39.24 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  39.62 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  78.57 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  38 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  36.84 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  30.93 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  61.76 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  43.9 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4095  comG operon protein 3  35.71 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.663959  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  43.1 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  40.58 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2448  hypothetical protein  58.82 
 
 		 186 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  51.28 
 
 		 212 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  58.33 
 
 		 362 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0134  hypothetical protein  32.43 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  62.07 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  47.54 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  31.78 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  68.97 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  39.29 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  37.76 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  45.71 
 
 		 173 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  42.86 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  77.78 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2553  hypothetical protein  29.58 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>