155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2448 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2448  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  373  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1569  pilin, type IV, putative  62 
 
 		 162 aa  157  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467783  hitchhiker  0.00664496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3772  hypothetical protein  59.33 
 
 		 181 aa  151  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.17734  normal  0.182511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2988  fimbrial protein pilin  60.26 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1570  pilin, type IV, putative  60 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0025614  normal  0.0450256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1602  pilin, type IV, putative  56.38 
 
 		 187 aa  137  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1888  hypothetical protein  50 
 
 		 254 aa  104  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.523825  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1887  hypothetical protein  42.11 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0692687  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4141  hypothetical protein  40.69 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3231  hypothetical protein  37.82 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.771885  decreased coverage  0.007242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  39.13 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  37.68 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2225  hypothetical protein  32.46 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000144782  normal  0.108692 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  51.85 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3610  hypothetical protein  30.97 
 
 		 315 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.166394 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  34.74 
 
 		 313 aa  52.4  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  48.15 
 
 		 115 aa  52  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  34.85 
 
 		 146 aa  51.6  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  39.44 
 
 		 176 aa  51.2  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  45.61 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  45.61 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  43.28 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  43.28 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  34.92 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  36.25 
 
 		 325 aa  48.9  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 153 aa  49.3  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 		 149 aa  48.9  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 144 aa  48.5  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  36.92 
 
 		 143 aa  48.5  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  41.07 
 
 		 330 aa  48.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  37.93 
 
 		 323 aa  47.8  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  39.19 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  52.27 
 
 		 118 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  35.62 
 
 		 124 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  32.31 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  32.81 
 
 		 146 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  32.81 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  32.81 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  42.86 
 
 		 138 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  26.72 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  32.81 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  26.28 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 146 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  34.25 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  30.99 
 
 		 141 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  29.03 
 
 		 146 aa  45.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 130 aa  45.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  35.62 
 
 		 124 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  35.62 
 
 		 128 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  36.11 
 
 		 135 aa  45.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  42.31 
 
 		 155 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  35.62 
 
 		 124 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 144 aa  44.7  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 144 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  37.31 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  24.7 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  32.81 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  38.6 
 
 		 326 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  37.93 
 
 		 324 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15291  Tfp pilus assembly protein PilE  31.19 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.420018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  38.1 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  34.25 
 
 		 124 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  56.41 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  39.39 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  59.26 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  29.03 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  37.31 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  26.53 
 
 		 131 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  40 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  37.5 
 
 		 349 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  56.41 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  29.87 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  43.33 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  36.21 
 
 		 323 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  56.41 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  30.95 
 
 		 130 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  34.38 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  55 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1088  hypothetical protein  32.91 
 
 		 338 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0638  fimbrillin  46.51 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.37134  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  34.25 
 
 		 124 aa  42.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  32.91 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  42.86 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  24.82 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  28.89 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  36.54 
 
 		 70 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  36.36 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  36.11 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>