42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3594 on replicon NC_014214
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014214  Mesil_3594  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  288  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  38.14 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  38.27 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  39.66 
 
 
164 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  39.76 
 
 
338 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  36.84 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  45.28 
 
 
323 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  43.33 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  40.35 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  34.48 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  38.46 
 
 
323 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  25.93 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1056  hypothetical protein  36.73 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  41.51 
 
 
362 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4154  hypothetical protein  35 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  43.4 
 
 
326 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  39.19 
 
 
313 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.91 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0201  type IV pilin-related protein  33.09 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225415  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  30.77 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  31.62 
 
 
142 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  33.33 
 
 
148 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  31.87 
 
 
155 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  43.4 
 
 
324 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  42.59 
 
 
133 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.21 
 
 
158 aa  41.2  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  39.62 
 
 
330 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  41.51 
 
 
325 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  40.35 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  31.67 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.72 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.32 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  34.55 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  42.31 
 
 
349 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  29.35 
 
 
159 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  31.15 
 
 
187 aa  40.4  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0583  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.19 
 
 
166 aa  40.4  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000427106 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  29.81 
 
 
135 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  38.89 
 
 
206 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  38.6 
 
 
154 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  36.84 
 
 
155 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>