160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0201 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0201  type IV pilin-related protein  100 
 
 		 145 aa  293  6e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225415  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  52.05 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0200  hypothetical protein  42.28 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000191145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0536  hypothetical protein  37.76 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1204  hypothetical protein  42.98 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00605175  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  54.9 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1548  type IV pilin-related protein  60 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000491286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.62 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  30.95 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  31.82 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  34.95 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  44.23 
 
 		 326 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.23 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  37.25 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  29.82 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  28.97 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  41.07 
 
 		 323 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  37.25 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  37.25 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  31.46 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  34.69 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  35.29 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  35.29 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  40.38 
 
 		 323 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  42.31 
 
 		 313 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.15 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  35.82 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  40.38 
 
 		 338 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  30.36 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.31 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  34.29 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  28.46 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  31.62 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  40.38 
 
 		 325 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  44 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  32.86 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  32.86 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0394  hypothetical protein  41.18 
 
 		 252 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  30.7 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  29.55 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  40.38 
 
 		 330 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  34.29 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  32.86 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  32.86 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  32.86 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  32.86 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  31.85 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  43.14 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.81 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  34.07 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.71 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  42.31 
 
 		 324 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  39.39 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  32.86 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  40.68 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.88 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  32.91 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  30.91 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  39.22 
 
 		 349 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  44 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  28.3 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  34.43 
 
 		 377 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  46 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  37.7 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  41.18 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.6 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1881  hypothetical protein  37.68 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00634101  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  32.86 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  42.55 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  39.22 
 
 		 348 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  32.86 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  32.86 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.28 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  32.76 
 
 		 362 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.67 
 
 		 168 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.1 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  32.86 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  55 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2274  prepilin peptidase dependent protein A precursor  28.1 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  28.41 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  34.43 
 
 		 193 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.36 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  38.46 
 
 		 321 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 124 aa  42.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  30.36 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1551  N-terminal methylation  45.28 
 
 		 171 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  37.25 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  27.97 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  38.46 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  31.18 
 
 		 182 aa  42.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  34.62 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  38 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3594  hypothetical protein  33.09 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  32.58 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  35.42 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  38.03 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  26.74 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  44 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>